Protein–RNA interactions for Protein: P12658

Calb1, Calbindin, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb1P12658 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Calb1P12658 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Calb1P12658 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Calb1P12658 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Calb1P12658 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Calb1P12658 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Calb1P12658 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Calb1P12658 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Calb1P12658 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Calb1P12658 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Calb1P12658 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Calb1P12658 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Calb1P12658 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Calb1P12658 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Calb1P12658 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Calb1P12658 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Calb1P12658 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Calb1P12658 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Calb1P12658 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Calb1P12658 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Calb1P12658 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Calb1P12658 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Calb1P12658 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Calb1P12658 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Calb1P12658 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Calb1P12658 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Calb1P12658 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Calb1P12658 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Calb1P12658 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Calb1P12658 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Calb1P12658 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Calb1P12658 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Calb1P12658 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Calb1P12658 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Calb1P12658 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Calb1P12658 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Calb1P12658 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Calb1P12658 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Calb1P12658 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Calb1P12658 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Calb1P12658 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Calb1P12658 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Calb1P12658 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Calb1P12658 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Calb1P12658 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Calb1P12658 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Calb1P12658 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Calb1P12658 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Calb1P12658 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Calb1P12658 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Calb1P12658 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Calb1P12658 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Calb1P12658 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Calb1P12658 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Calb1P12658 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Calb1P12658 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Calb1P12658 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Calb1P12658 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Calb1P12658 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Calb1P12658 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Calb1P12658 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Calb1P12658 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Calb1P12658 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Calb1P12658 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Calb1P12658 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Calb1P12658 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Calb1P12658 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Calb1P12658 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Calb1P12658 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Calb1P12658 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Calb1P12658 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Calb1P12658 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Calb1P12658 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Calb1P12658 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Calb1P12658 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Calb1P12658 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Calb1P12658 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Calb1P12658 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Calb1P12658 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Calb1P12658 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Calb1P12658 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Calb1P12658 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Calb1P12658 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Calb1P12658 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Calb1P12658 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Calb1P12658 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Calb1P12658 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Calb1P12658 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Calb1P12658 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Calb1P12658 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Calb1P12658 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Calb1P12658 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Calb1P12658 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Calb1P12658 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Calb1P12658 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Calb1P12658 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Calb1P12658 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Calb1P12658 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Calb1P12658 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Calb1P12658 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms