Protein–RNA interactions for Protein: P11725

Otc, Ornithine carbamoyltransferase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtcP11725 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
OtcP11725 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
OtcP11725 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
OtcP11725 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
OtcP11725 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
OtcP11725 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
OtcP11725 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
OtcP11725 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
OtcP11725 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
OtcP11725 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
OtcP11725 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
OtcP11725 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
OtcP11725 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
OtcP11725 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
OtcP11725 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
OtcP11725 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
OtcP11725 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
OtcP11725 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
OtcP11725 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
OtcP11725 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
OtcP11725 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
OtcP11725 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
OtcP11725 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
OtcP11725 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
OtcP11725 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
OtcP11725 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
OtcP11725 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
OtcP11725 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
OtcP11725 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
OtcP11725 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
OtcP11725 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
OtcP11725 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
OtcP11725 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
OtcP11725 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
OtcP11725 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
OtcP11725 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
OtcP11725 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
OtcP11725 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
OtcP11725 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
OtcP11725 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
OtcP11725 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
OtcP11725 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
OtcP11725 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
OtcP11725 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
OtcP11725 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
OtcP11725 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
OtcP11725 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
OtcP11725 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
OtcP11725 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
OtcP11725 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
OtcP11725 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
OtcP11725 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
OtcP11725 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
OtcP11725 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
OtcP11725 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
OtcP11725 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
OtcP11725 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
OtcP11725 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
OtcP11725 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
OtcP11725 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
OtcP11725 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
OtcP11725 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
OtcP11725 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
OtcP11725 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
OtcP11725 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
OtcP11725 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
OtcP11725 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
OtcP11725 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
OtcP11725 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
OtcP11725 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
OtcP11725 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
OtcP11725 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
OtcP11725 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
OtcP11725 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
OtcP11725 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
OtcP11725 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
OtcP11725 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
OtcP11725 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
OtcP11725 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
OtcP11725 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
OtcP11725 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
OtcP11725 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
OtcP11725 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
OtcP11725 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
OtcP11725 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
OtcP11725 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
OtcP11725 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
OtcP11725 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
OtcP11725 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
OtcP11725 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
OtcP11725 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
OtcP11725 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
OtcP11725 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
OtcP11725 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
OtcP11725 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
OtcP11725 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
OtcP11725 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
OtcP11725 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
OtcP11725 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
OtcP11725 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.1 ms