Protein–RNA interactions for Protein: P11609

Cd1d1, Antigen-presenting glycoprotein CD1d1, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd1d1P11609 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cd1d1P11609 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cd1d1P11609 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cd1d1P11609 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cd1d1P11609 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cd1d1P11609 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cd1d1P11609 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cd1d1P11609 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Cd1d1P11609 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cd1d1P11609 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cd1d1P11609 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cd1d1P11609 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cd1d1P11609 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cd1d1P11609 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cd1d1P11609 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cd1d1P11609 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cd1d1P11609 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cd1d1P11609 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cd1d1P11609 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cd1d1P11609 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Cd1d1P11609 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cd1d1P11609 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cd1d1P11609 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cd1d1P11609 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cd1d1P11609 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cd1d1P11609 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cd1d1P11609 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cd1d1P11609 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cd1d1P11609 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cd1d1P11609 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cd1d1P11609 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Cd1d1P11609 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cd1d1P11609 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cd1d1P11609 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cd1d1P11609 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cd1d1P11609 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cd1d1P11609 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cd1d1P11609 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cd1d1P11609 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cd1d1P11609 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cd1d1P11609 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Cd1d1P11609 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Cd1d1P11609 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cd1d1P11609 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cd1d1P11609 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cd1d1P11609 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cd1d1P11609 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cd1d1P11609 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cd1d1P11609 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cd1d1P11609 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cd1d1P11609 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cd1d1P11609 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cd1d1P11609 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cd1d1P11609 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cd1d1P11609 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cd1d1P11609 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cd1d1P11609 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cd1d1P11609 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cd1d1P11609 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cd1d1P11609 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cd1d1P11609 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Cd1d1P11609 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cd1d1P11609 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cd1d1P11609 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Cd1d1P11609 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cd1d1P11609 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cd1d1P11609 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cd1d1P11609 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cd1d1P11609 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cd1d1P11609 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cd1d1P11609 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cd1d1P11609 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cd1d1P11609 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Cd1d1P11609 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cd1d1P11609 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cd1d1P11609 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cd1d1P11609 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cd1d1P11609 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cd1d1P11609 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cd1d1P11609 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cd1d1P11609 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Cd1d1P11609 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cd1d1P11609 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cd1d1P11609 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cd1d1P11609 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cd1d1P11609 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cd1d1P11609 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cd1d1P11609 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cd1d1P11609 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cd1d1P11609 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cd1d1P11609 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cd1d1P11609 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cd1d1P11609 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cd1d1P11609 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cd1d1P11609 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cd1d1P11609 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cd1d1P11609 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cd1d1P11609 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cd1d1P11609 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Cd1d1P11609 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms