Protein–RNA interactions for Protein: P11416

Rara, Retinoic acid receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RaraP11416 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RaraP11416 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RaraP11416 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RaraP11416 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RaraP11416 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RaraP11416 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RaraP11416 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
RaraP11416 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RaraP11416 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RaraP11416 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RaraP11416 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RaraP11416 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RaraP11416 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RaraP11416 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RaraP11416 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RaraP11416 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RaraP11416 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
RaraP11416 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RaraP11416 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RaraP11416 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RaraP11416 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RaraP11416 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RaraP11416 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RaraP11416 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
RaraP11416 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RaraP11416 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RaraP11416 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RaraP11416 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RaraP11416 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RaraP11416 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RaraP11416 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RaraP11416 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RaraP11416 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RaraP11416 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RaraP11416 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RaraP11416 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RaraP11416 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RaraP11416 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RaraP11416 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RaraP11416 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RaraP11416 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RaraP11416 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RaraP11416 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RaraP11416 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RaraP11416 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RaraP11416 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RaraP11416 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RaraP11416 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RaraP11416 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RaraP11416 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RaraP11416 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RaraP11416 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RaraP11416 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RaraP11416 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RaraP11416 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RaraP11416 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RaraP11416 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RaraP11416 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RaraP11416 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RaraP11416 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RaraP11416 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RaraP11416 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RaraP11416 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RaraP11416 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RaraP11416 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RaraP11416 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RaraP11416 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RaraP11416 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RaraP11416 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RaraP11416 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RaraP11416 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RaraP11416 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RaraP11416 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RaraP11416 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RaraP11416 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RaraP11416 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RaraP11416 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RaraP11416 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RaraP11416 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RaraP11416 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RaraP11416 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RaraP11416 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RaraP11416 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RaraP11416 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RaraP11416 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
RaraP11416 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RaraP11416 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RaraP11416 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RaraP11416 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RaraP11416 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RaraP11416 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RaraP11416 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RaraP11416 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RaraP11416 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RaraP11416 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RaraP11416 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RaraP11416 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RaraP11416 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
RaraP11416 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RaraP11416 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms