Protein–RNA interactions for Protein: P10400

Pol, Retrovirus-related Pol polyprotein (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolP10400 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PolP10400 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PolP10400 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PolP10400 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PolP10400 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PolP10400 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PolP10400 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PolP10400 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PolP10400 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PolP10400 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PolP10400 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PolP10400 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PolP10400 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PolP10400 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PolP10400 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PolP10400 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PolP10400 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PolP10400 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PolP10400 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PolP10400 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PolP10400 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PolP10400 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PolP10400 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PolP10400 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PolP10400 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PolP10400 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PolP10400 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PolP10400 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PolP10400 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PolP10400 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PolP10400 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PolP10400 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PolP10400 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PolP10400 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PolP10400 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PolP10400 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PolP10400 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PolP10400 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PolP10400 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PolP10400 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PolP10400 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PolP10400 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PolP10400 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PolP10400 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PolP10400 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PolP10400 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PolP10400 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PolP10400 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PolP10400 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PolP10400 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PolP10400 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PolP10400 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PolP10400 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PolP10400 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PolP10400 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PolP10400 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PolP10400 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PolP10400 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PolP10400 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PolP10400 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PolP10400 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PolP10400 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PolP10400 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
PolP10400 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PolP10400 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PolP10400 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PolP10400 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PolP10400 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PolP10400 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
PolP10400 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PolP10400 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PolP10400 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PolP10400 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PolP10400 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PolP10400 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PolP10400 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PolP10400 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PolP10400 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PolP10400 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PolP10400 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PolP10400 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PolP10400 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PolP10400 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PolP10400 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PolP10400 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PolP10400 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PolP10400 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PolP10400 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PolP10400 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PolP10400 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PolP10400 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PolP10400 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PolP10400 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PolP10400 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PolP10400 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PolP10400 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PolP10400 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PolP10400 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PolP10400 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PolP10400 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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