Protein–RNA interactions for Protein: P0DP28

Calm3, Calmodulin-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 149 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calm3P0DP28 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Calm3P0DP28 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Calm3P0DP28 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Calm3P0DP28 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Calm3P0DP28 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Calm3P0DP28 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Calm3P0DP28 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Calm3P0DP28 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Calm3P0DP28 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Calm3P0DP28 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Calm3P0DP28 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Calm3P0DP28 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Calm3P0DP28 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Calm3P0DP28 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Calm3P0DP28 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Calm3P0DP28 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Calm3P0DP28 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Calm3P0DP28 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Calm3P0DP28 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Calm3P0DP28 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Calm3P0DP28 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Calm3P0DP28 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Calm3P0DP28 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Calm3P0DP28 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Calm3P0DP28 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Calm3P0DP28 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Calm3P0DP28 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Calm3P0DP28 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Calm3P0DP28 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Calm3P0DP28 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Calm3P0DP28 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Calm3P0DP28 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Calm3P0DP28 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Calm3P0DP28 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Calm3P0DP28 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Calm3P0DP28 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Calm3P0DP28 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Calm3P0DP28 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Calm3P0DP28 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Calm3P0DP28 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Calm3P0DP28 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Calm3P0DP28 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Calm3P0DP28 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Calm3P0DP28 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Calm3P0DP28 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Calm3P0DP28 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Calm3P0DP28 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Calm3P0DP28 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Calm3P0DP28 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Calm3P0DP28 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Calm3P0DP28 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Calm3P0DP28 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Calm3P0DP28 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Calm3P0DP28 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Calm3P0DP28 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Calm3P0DP28 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Calm3P0DP28 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Calm3P0DP28 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Calm3P0DP28 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Calm3P0DP28 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Calm3P0DP28 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Calm3P0DP28 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Calm3P0DP28 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Calm3P0DP28 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Calm3P0DP28 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Calm3P0DP28 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Calm3P0DP28 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Calm3P0DP28 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Calm3P0DP28 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Calm3P0DP28 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Calm3P0DP28 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Calm3P0DP28 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Calm3P0DP28 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Calm3P0DP28 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Calm3P0DP28 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Calm3P0DP28 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Calm3P0DP28 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Calm3P0DP28 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Calm3P0DP28 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Calm3P0DP28 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Calm3P0DP28 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Calm3P0DP28 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Calm3P0DP28 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Calm3P0DP28 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Calm3P0DP28 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Calm3P0DP28 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Calm3P0DP28 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Calm3P0DP28 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Calm3P0DP28 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Calm3P0DP28 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Calm3P0DP28 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Calm3P0DP28 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Calm3P0DP28 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Calm3P0DP28 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Calm3P0DP28 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Calm3P0DP28 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Calm3P0DP28 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Calm3P0DP28 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Calm3P0DP28 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Calm3P0DP28 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms