Protein–RNA interactions for Protein: P0DN90

Tmem254b, Transmembrane protein 254b, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem254bP0DN90 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmem254bP0DN90 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmem254bP0DN90 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmem254bP0DN90 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmem254bP0DN90 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmem254bP0DN90 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmem254bP0DN90 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmem254bP0DN90 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmem254bP0DN90 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmem254bP0DN90 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmem254bP0DN90 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmem254bP0DN90 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmem254bP0DN90 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmem254bP0DN90 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmem254bP0DN90 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmem254bP0DN90 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmem254bP0DN90 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmem254bP0DN90 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmem254bP0DN90 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmem254bP0DN90 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmem254bP0DN90 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmem254bP0DN90 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmem254bP0DN90 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmem254bP0DN90 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmem254bP0DN90 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmem254bP0DN90 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmem254bP0DN90 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmem254bP0DN90 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Tmem254bP0DN90 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Tmem254bP0DN90 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Tmem254bP0DN90 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Tmem254bP0DN90 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Tmem254bP0DN90 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Tmem254bP0DN90 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Tmem254bP0DN90 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tmem254bP0DN90 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tmem254bP0DN90 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tmem254bP0DN90 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tmem254bP0DN90 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tmem254bP0DN90 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tmem254bP0DN90 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tmem254bP0DN90 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tmem254bP0DN90 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tmem254bP0DN90 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tmem254bP0DN90 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tmem254bP0DN90 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tmem254bP0DN90 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tmem254bP0DN90 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tmem254bP0DN90 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tmem254bP0DN90 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmem254bP0DN90 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmem254bP0DN90 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmem254bP0DN90 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmem254bP0DN90 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmem254bP0DN90 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmem254bP0DN90 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmem254bP0DN90 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmem254bP0DN90 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmem254bP0DN90 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmem254bP0DN90 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmem254bP0DN90 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmem254bP0DN90 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmem254bP0DN90 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmem254bP0DN90 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmem254bP0DN90 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmem254bP0DN90 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmem254bP0DN90 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmem254bP0DN90 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmem254bP0DN90 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmem254bP0DN90 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmem254bP0DN90 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmem254bP0DN90 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmem254bP0DN90 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmem254bP0DN90 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmem254bP0DN90 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmem254bP0DN90 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmem254bP0DN90 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmem254bP0DN90 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmem254bP0DN90 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmem254bP0DN90 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmem254bP0DN90 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmem254bP0DN90 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmem254bP0DN90 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmem254bP0DN90 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmem254bP0DN90 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmem254bP0DN90 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmem254bP0DN90 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmem254bP0DN90 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmem254bP0DN90 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmem254bP0DN90 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmem254bP0DN90 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmem254bP0DN90 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmem254bP0DN90 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmem254bP0DN90 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmem254bP0DN90 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmem254bP0DN90 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmem254bP0DN90 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmem254bP0DN90 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmem254bP0DN90 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmem254bP0DN90 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms