Protein–RNA interactions for Protein: P04919

Slc4a1, Band 3 anion transport protein, mousemouse

Predictions only

Length 929 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc4a1P04919 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Slc4a1P04919 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Slc4a1P04919 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Slc4a1P04919 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Slc4a1P04919 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Slc4a1P04919 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Slc4a1P04919 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Slc4a1P04919 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Slc4a1P04919 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Slc4a1P04919 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Slc4a1P04919 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Slc4a1P04919 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Slc4a1P04919 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Slc4a1P04919 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Slc4a1P04919 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Slc4a1P04919 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Slc4a1P04919 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Slc4a1P04919 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Slc4a1P04919 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Slc4a1P04919 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Slc4a1P04919 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Slc4a1P04919 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Slc4a1P04919 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Slc4a1P04919 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Slc4a1P04919 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Slc4a1P04919 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Slc4a1P04919 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Slc4a1P04919 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Slc4a1P04919 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Slc4a1P04919 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Slc4a1P04919 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Slc4a1P04919 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Slc4a1P04919 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Slc4a1P04919 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Slc4a1P04919 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Slc4a1P04919 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Slc4a1P04919 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Slc4a1P04919 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Slc4a1P04919 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Slc4a1P04919 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Slc4a1P04919 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Slc4a1P04919 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Slc4a1P04919 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Slc4a1P04919 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Slc4a1P04919 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Slc4a1P04919 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Slc4a1P04919 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Slc4a1P04919 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Slc4a1P04919 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Slc4a1P04919 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Slc4a1P04919 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Slc4a1P04919 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Slc4a1P04919 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Slc4a1P04919 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Slc4a1P04919 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Slc4a1P04919 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Slc4a1P04919 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Slc4a1P04919 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Slc4a1P04919 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Slc4a1P04919 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Slc4a1P04919 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Slc4a1P04919 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Slc4a1P04919 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Slc4a1P04919 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Slc4a1P04919 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Slc4a1P04919 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Slc4a1P04919 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Slc4a1P04919 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Slc4a1P04919 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Slc4a1P04919 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Slc4a1P04919 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Slc4a1P04919 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Slc4a1P04919 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Slc4a1P04919 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Slc4a1P04919 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Slc4a1P04919 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Slc4a1P04919 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Slc4a1P04919 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Slc4a1P04919 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Slc4a1P04919 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Slc4a1P04919 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Slc4a1P04919 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Slc4a1P04919 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Slc4a1P04919 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Slc4a1P04919 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Slc4a1P04919 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Slc4a1P04919 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Slc4a1P04919 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Slc4a1P04919 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Slc4a1P04919 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Slc4a1P04919 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Slc4a1P04919 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Slc4a1P04919 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Slc4a1P04919 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Slc4a1P04919 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Slc4a1P04919 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Slc4a1P04919 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Slc4a1P04919 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Slc4a1P04919 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Slc4a1P04919 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms