Protein–RNA interactions for Protein: P01915

H-2 class II histocompatibility antigen, E-D beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01915 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01915 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01915 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01915 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01915 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01915 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01915 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01915 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01915 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01915 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01915 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01915 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
P01915 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01915 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01915 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
P01915 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01915 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01915 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
P01915 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01915 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01915 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01915 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01915 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01915 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01915 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01915 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01915 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01915 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01915 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01915 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01915 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01915 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
P01915 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01915 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01915 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01915 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01915 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01915 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01915 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01915 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01915 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01915 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01915 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01915 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01915 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01915 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01915 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01915 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01915 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01915 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01915 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01915 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01915 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01915 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01915 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01915 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01915 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01915 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01915 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
P01915 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
P01915 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
P01915 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01915 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01915 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01915 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01915 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01915 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01915 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01915 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01915 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01915 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01915 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01915 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01915 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01915 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01915 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01915 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
P01915 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01915 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01915 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01915 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01915 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01915 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01915 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01915 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01915 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01915 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01915 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01915 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01915 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01915 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
P01915 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01915 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01915 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01915 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01915 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01915 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01915 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01915 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01915 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 165.2 ms