Protein–RNA interactions for Protein: P01797

Ig heavy chain V-III region U61, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01797 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
P01797 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01797 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01797 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
P01797 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01797 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01797 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
P01797 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01797 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01797 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01797 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01797 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01797 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01797 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01797 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01797 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01797 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01797 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01797 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01797 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
P01797 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01797 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01797 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01797 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01797 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01797 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01797 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01797 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01797 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01797 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01797 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01797 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01797 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01797 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
P01797 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
P01797 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
P01797 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01797 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01797 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01797 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01797 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01797 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01797 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01797 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01797 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01797 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01797 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01797 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01797 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01797 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01797 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01797 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01797 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01797 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
P01797 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
P01797 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01797 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01797 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01797 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01797 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01797 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01797 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01797 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01797 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01797 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01797 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01797 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01797 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01797 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01797 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01797 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01797 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01797 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01797 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01797 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01797 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01797 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01797 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01797 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01797 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01797 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P01797 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P01797 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
P01797 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
P01797 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P01797 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P01797 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P01797 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P01797 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P01797 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
P01797 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P01797 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P01797 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P01797 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P01797 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
P01797 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
P01797 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P01797 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P01797 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
P01797 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 840.3 ms