Protein–RNA interactions for Protein: P01680

Ig kappa chain V-IV region S107B, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01680 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
P01680 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
P01680 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
P01680 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
P01680 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
P01680 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
P01680 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
P01680 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
P01680 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
P01680 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
P01680 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
P01680 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
P01680 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
P01680 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
P01680 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
P01680 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
P01680 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
P01680 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
P01680 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
P01680 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
P01680 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
P01680 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
P01680 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
P01680 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
P01680 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
P01680 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
P01680 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
P01680 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
P01680 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
P01680 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
P01680 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
P01680 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
P01680 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
P01680 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
P01680 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
P01680 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
P01680 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
P01680 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
P01680 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
P01680 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
P01680 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
P01680 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
P01680 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
P01680 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
P01680 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01680 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01680 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01680 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01680 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01680 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01680 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01680 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
P01680 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
P01680 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01680 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01680 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01680 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01680 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01680 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01680 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01680 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01680 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01680 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01680 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01680 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01680 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01680 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01680 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01680 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01680 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01680 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01680 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01680 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01680 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01680 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01680 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01680 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01680 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01680 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01680 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01680 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01680 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01680 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01680 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01680 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01680 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01680 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
P01680 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01680 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01680 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01680 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01680 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
P01680 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
P01680 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01680 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01680 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01680 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01680 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01680 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01680 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms