Protein–RNA interactions for Protein: P01572

Ifna1, Interferon alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna1P01572 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ifna1P01572 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ifna1P01572 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ifna1P01572 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ifna1P01572 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ifna1P01572 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ifna1P01572 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ifna1P01572 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ifna1P01572 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ifna1P01572 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ifna1P01572 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ifna1P01572 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ifna1P01572 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ifna1P01572 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ifna1P01572 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ifna1P01572 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ifna1P01572 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ifna1P01572 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ifna1P01572 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ifna1P01572 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ifna1P01572 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ifna1P01572 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ifna1P01572 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ifna1P01572 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ifna1P01572 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ifna1P01572 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ifna1P01572 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ifna1P01572 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ifna1P01572 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ifna1P01572 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ifna1P01572 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ifna1P01572 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ifna1P01572 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ifna1P01572 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ifna1P01572 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ifna1P01572 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ifna1P01572 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ifna1P01572 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ifna1P01572 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ifna1P01572 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ifna1P01572 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ifna1P01572 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ifna1P01572 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ifna1P01572 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ifna1P01572 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ifna1P01572 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ifna1P01572 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ifna1P01572 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ifna1P01572 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ifna1P01572 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ifna1P01572 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ifna1P01572 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ifna1P01572 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ifna1P01572 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ifna1P01572 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ifna1P01572 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ifna1P01572 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ifna1P01572 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ifna1P01572 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ifna1P01572 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ifna1P01572 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ifna1P01572 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ifna1P01572 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ifna1P01572 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ifna1P01572 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ifna1P01572 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ifna1P01572 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ifna1P01572 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ifna1P01572 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ifna1P01572 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ifna1P01572 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ifna1P01572 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ifna1P01572 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ifna1P01572 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ifna1P01572 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ifna1P01572 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ifna1P01572 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ifna1P01572 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ifna1P01572 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ifna1P01572 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ifna1P01572 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ifna1P01572 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ifna1P01572 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ifna1P01572 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ifna1P01572 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ifna1P01572 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ifna1P01572 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ifna1P01572 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ifna1P01572 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ifna1P01572 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ifna1P01572 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ifna1P01572 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ifna1P01572 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ifna1P01572 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ifna1P01572 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ifna1P01572 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ifna1P01572 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ifna1P01572 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ifna1P01572 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ifna1P01572 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms