Protein–RNA interactions for Protein: P00860

Odc1, Ornithine decarboxylase, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odc1P00860 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Odc1P00860 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Odc1P00860 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Odc1P00860 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Odc1P00860 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Odc1P00860 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Odc1P00860 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Odc1P00860 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Odc1P00860 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Odc1P00860 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Odc1P00860 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Odc1P00860 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Odc1P00860 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Odc1P00860 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Odc1P00860 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Odc1P00860 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Odc1P00860 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Odc1P00860 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Odc1P00860 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Odc1P00860 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Odc1P00860 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Odc1P00860 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Odc1P00860 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Odc1P00860 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Odc1P00860 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Odc1P00860 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Odc1P00860 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Odc1P00860 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Odc1P00860 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Odc1P00860 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Odc1P00860 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Odc1P00860 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Odc1P00860 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Odc1P00860 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Odc1P00860 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Odc1P00860 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Odc1P00860 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Odc1P00860 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Odc1P00860 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Odc1P00860 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Odc1P00860 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Odc1P00860 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Odc1P00860 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Odc1P00860 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Odc1P00860 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Odc1P00860 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Odc1P00860 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Odc1P00860 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Odc1P00860 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Odc1P00860 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Odc1P00860 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Odc1P00860 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Odc1P00860 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Odc1P00860 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Odc1P00860 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Odc1P00860 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Odc1P00860 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Odc1P00860 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Odc1P00860 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Odc1P00860 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Odc1P00860 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Odc1P00860 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Odc1P00860 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Odc1P00860 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Odc1P00860 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Odc1P00860 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Odc1P00860 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Odc1P00860 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Odc1P00860 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Odc1P00860 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Odc1P00860 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Odc1P00860 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Odc1P00860 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Odc1P00860 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Odc1P00860 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Odc1P00860 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Odc1P00860 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Odc1P00860 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Odc1P00860 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Odc1P00860 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Odc1P00860 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Odc1P00860 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Odc1P00860 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Odc1P00860 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Odc1P00860 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Odc1P00860 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Odc1P00860 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Odc1P00860 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Odc1P00860 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Odc1P00860 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Odc1P00860 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Odc1P00860 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Odc1P00860 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Odc1P00860 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Odc1P00860 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Odc1P00860 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Odc1P00860 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Odc1P00860 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Odc1P00860 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Odc1P00860 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms