Protein–RNA interactions for Protein: O88879

Apaf1, Apoptotic protease-activating factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apaf1O88879 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Apaf1O88879 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Apaf1O88879 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Apaf1O88879 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Apaf1O88879 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Apaf1O88879 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Apaf1O88879 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Apaf1O88879 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Apaf1O88879 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Apaf1O88879 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Apaf1O88879 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Apaf1O88879 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Apaf1O88879 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Apaf1O88879 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Apaf1O88879 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Apaf1O88879 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Apaf1O88879 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Apaf1O88879 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Apaf1O88879 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Apaf1O88879 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Apaf1O88879 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Apaf1O88879 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Apaf1O88879 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Apaf1O88879 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Apaf1O88879 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Apaf1O88879 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Apaf1O88879 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Apaf1O88879 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Apaf1O88879 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Apaf1O88879 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Apaf1O88879 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Apaf1O88879 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Apaf1O88879 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Apaf1O88879 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Apaf1O88879 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Apaf1O88879 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Apaf1O88879 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Apaf1O88879 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Apaf1O88879 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Apaf1O88879 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Apaf1O88879 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Apaf1O88879 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Apaf1O88879 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Apaf1O88879 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Apaf1O88879 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Apaf1O88879 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Apaf1O88879 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Apaf1O88879 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Apaf1O88879 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Apaf1O88879 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Apaf1O88879 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Apaf1O88879 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Apaf1O88879 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Apaf1O88879 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Apaf1O88879 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Apaf1O88879 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Apaf1O88879 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Apaf1O88879 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Apaf1O88879 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Apaf1O88879 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Apaf1O88879 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Apaf1O88879 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Apaf1O88879 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Apaf1O88879 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Apaf1O88879 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Apaf1O88879 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Apaf1O88879 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Apaf1O88879 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Apaf1O88879 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Apaf1O88879 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Apaf1O88879 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Apaf1O88879 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Apaf1O88879 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Apaf1O88879 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Apaf1O88879 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Apaf1O88879 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Apaf1O88879 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Apaf1O88879 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Apaf1O88879 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Apaf1O88879 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Apaf1O88879 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Apaf1O88879 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Apaf1O88879 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Apaf1O88879 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Apaf1O88879 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Apaf1O88879 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Apaf1O88879 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Apaf1O88879 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Apaf1O88879 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Apaf1O88879 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Apaf1O88879 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Apaf1O88879 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Apaf1O88879 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Apaf1O88879 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Apaf1O88879 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Apaf1O88879 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Apaf1O88879 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Apaf1O88879 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Apaf1O88879 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Apaf1O88879 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms