Protein–RNA interactions for Protein: O88703

Hcn2, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 2, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcn2O88703 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hcn2O88703 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Hcn2O88703 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Hcn2O88703 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Hcn2O88703 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hcn2O88703 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hcn2O88703 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hcn2O88703 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hcn2O88703 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hcn2O88703 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hcn2O88703 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hcn2O88703 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hcn2O88703 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hcn2O88703 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hcn2O88703 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hcn2O88703 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hcn2O88703 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Hcn2O88703 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hcn2O88703 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hcn2O88703 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hcn2O88703 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hcn2O88703 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hcn2O88703 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hcn2O88703 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hcn2O88703 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Hcn2O88703 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hcn2O88703 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hcn2O88703 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hcn2O88703 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hcn2O88703 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hcn2O88703 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hcn2O88703 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hcn2O88703 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hcn2O88703 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hcn2O88703 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hcn2O88703 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hcn2O88703 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hcn2O88703 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hcn2O88703 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hcn2O88703 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hcn2O88703 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hcn2O88703 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hcn2O88703 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hcn2O88703 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hcn2O88703 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hcn2O88703 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hcn2O88703 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hcn2O88703 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hcn2O88703 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hcn2O88703 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hcn2O88703 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hcn2O88703 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hcn2O88703 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hcn2O88703 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hcn2O88703 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hcn2O88703 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hcn2O88703 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hcn2O88703 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Hcn2O88703 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hcn2O88703 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Hcn2O88703 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hcn2O88703 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hcn2O88703 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hcn2O88703 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hcn2O88703 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hcn2O88703 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hcn2O88703 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hcn2O88703 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hcn2O88703 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hcn2O88703 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hcn2O88703 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hcn2O88703 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hcn2O88703 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hcn2O88703 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hcn2O88703 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hcn2O88703 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hcn2O88703 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hcn2O88703 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hcn2O88703 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hcn2O88703 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hcn2O88703 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hcn2O88703 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hcn2O88703 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Hcn2O88703 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hcn2O88703 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hcn2O88703 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hcn2O88703 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hcn2O88703 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hcn2O88703 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hcn2O88703 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hcn2O88703 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hcn2O88703 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hcn2O88703 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hcn2O88703 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Hcn2O88703 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hcn2O88703 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Hcn2O88703 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Hcn2O88703 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hcn2O88703 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hcn2O88703 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms