Protein–RNA interactions for Protein: O88351

Ikbkb, Inhibitor of nuclear factor kappa-B kinase subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 757 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IkbkbO88351 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
IkbkbO88351 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IkbkbO88351 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IkbkbO88351 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IkbkbO88351 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IkbkbO88351 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IkbkbO88351 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IkbkbO88351 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
IkbkbO88351 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IkbkbO88351 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
IkbkbO88351 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
IkbkbO88351 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
IkbkbO88351 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IkbkbO88351 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IkbkbO88351 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IkbkbO88351 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IkbkbO88351 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IkbkbO88351 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IkbkbO88351 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IkbkbO88351 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
IkbkbO88351 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IkbkbO88351 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IkbkbO88351 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IkbkbO88351 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IkbkbO88351 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IkbkbO88351 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
IkbkbO88351 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
IkbkbO88351 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IkbkbO88351 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IkbkbO88351 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IkbkbO88351 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IkbkbO88351 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IkbkbO88351 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IkbkbO88351 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IkbkbO88351 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IkbkbO88351 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
IkbkbO88351 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IkbkbO88351 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IkbkbO88351 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IkbkbO88351 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IkbkbO88351 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IkbkbO88351 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
IkbkbO88351 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IkbkbO88351 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IkbkbO88351 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IkbkbO88351 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IkbkbO88351 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IkbkbO88351 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IkbkbO88351 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
IkbkbO88351 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
IkbkbO88351 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
IkbkbO88351 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IkbkbO88351 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
IkbkbO88351 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
IkbkbO88351 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
IkbkbO88351 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IkbkbO88351 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IkbkbO88351 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IkbkbO88351 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IkbkbO88351 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IkbkbO88351 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IkbkbO88351 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IkbkbO88351 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IkbkbO88351 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
IkbkbO88351 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
IkbkbO88351 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
IkbkbO88351 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
IkbkbO88351 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IkbkbO88351 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IkbkbO88351 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
IkbkbO88351 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
IkbkbO88351 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
IkbkbO88351 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IkbkbO88351 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IkbkbO88351 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
IkbkbO88351 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IkbkbO88351 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IkbkbO88351 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IkbkbO88351 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IkbkbO88351 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IkbkbO88351 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IkbkbO88351 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IkbkbO88351 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IkbkbO88351 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IkbkbO88351 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IkbkbO88351 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IkbkbO88351 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IkbkbO88351 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IkbkbO88351 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IkbkbO88351 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IkbkbO88351 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IkbkbO88351 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IkbkbO88351 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IkbkbO88351 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IkbkbO88351 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IkbkbO88351 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IkbkbO88351 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IkbkbO88351 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IkbkbO88351 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IkbkbO88351 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms