Protein–RNA interactions for Protein: O88271

Cfdp1, Craniofacial development protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfdp1O88271 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cfdp1O88271 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cfdp1O88271 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cfdp1O88271 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cfdp1O88271 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cfdp1O88271 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cfdp1O88271 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cfdp1O88271 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cfdp1O88271 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cfdp1O88271 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Cfdp1O88271 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cfdp1O88271 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cfdp1O88271 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cfdp1O88271 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cfdp1O88271 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cfdp1O88271 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cfdp1O88271 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cfdp1O88271 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cfdp1O88271 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cfdp1O88271 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cfdp1O88271 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cfdp1O88271 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cfdp1O88271 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Cfdp1O88271 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Cfdp1O88271 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cfdp1O88271 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cfdp1O88271 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cfdp1O88271 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Cfdp1O88271 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cfdp1O88271 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cfdp1O88271 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cfdp1O88271 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cfdp1O88271 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cfdp1O88271 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cfdp1O88271 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cfdp1O88271 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Cfdp1O88271 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cfdp1O88271 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cfdp1O88271 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cfdp1O88271 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cfdp1O88271 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cfdp1O88271 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cfdp1O88271 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cfdp1O88271 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cfdp1O88271 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cfdp1O88271 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cfdp1O88271 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cfdp1O88271 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cfdp1O88271 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cfdp1O88271 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cfdp1O88271 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cfdp1O88271 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Cfdp1O88271 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cfdp1O88271 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cfdp1O88271 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cfdp1O88271 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cfdp1O88271 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cfdp1O88271 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cfdp1O88271 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cfdp1O88271 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cfdp1O88271 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cfdp1O88271 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Cfdp1O88271 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cfdp1O88271 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cfdp1O88271 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cfdp1O88271 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cfdp1O88271 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cfdp1O88271 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cfdp1O88271 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cfdp1O88271 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cfdp1O88271 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cfdp1O88271 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Cfdp1O88271 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cfdp1O88271 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cfdp1O88271 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cfdp1O88271 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cfdp1O88271 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cfdp1O88271 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cfdp1O88271 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cfdp1O88271 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cfdp1O88271 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cfdp1O88271 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cfdp1O88271 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cfdp1O88271 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cfdp1O88271 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cfdp1O88271 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cfdp1O88271 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cfdp1O88271 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cfdp1O88271 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cfdp1O88271 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Cfdp1O88271 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Cfdp1O88271 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Cfdp1O88271 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cfdp1O88271 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cfdp1O88271 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cfdp1O88271 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cfdp1O88271 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cfdp1O88271 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cfdp1O88271 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cfdp1O88271 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms