Protein–RNA interactions for Protein: O70373

Xirp1, Xin actin-binding repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xirp1O70373 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Xirp1O70373 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Xirp1O70373 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Xirp1O70373 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Xirp1O70373 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Xirp1O70373 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Xirp1O70373 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Xirp1O70373 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Xirp1O70373 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Xirp1O70373 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Xirp1O70373 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Xirp1O70373 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Xirp1O70373 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Xirp1O70373 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Xirp1O70373 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Xirp1O70373 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Xirp1O70373 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Xirp1O70373 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Xirp1O70373 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Xirp1O70373 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Xirp1O70373 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Xirp1O70373 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Xirp1O70373 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Xirp1O70373 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Xirp1O70373 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Xirp1O70373 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Xirp1O70373 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Xirp1O70373 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Xirp1O70373 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Xirp1O70373 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Xirp1O70373 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Xirp1O70373 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Xirp1O70373 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Xirp1O70373 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Xirp1O70373 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Xirp1O70373 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Xirp1O70373 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Xirp1O70373 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Xirp1O70373 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Xirp1O70373 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Xirp1O70373 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Xirp1O70373 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Xirp1O70373 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Xirp1O70373 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Xirp1O70373 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Xirp1O70373 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Xirp1O70373 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Xirp1O70373 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Xirp1O70373 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Xirp1O70373 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Xirp1O70373 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Xirp1O70373 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Xirp1O70373 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Xirp1O70373 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Xirp1O70373 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Xirp1O70373 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Xirp1O70373 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Xirp1O70373 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Xirp1O70373 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Xirp1O70373 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Xirp1O70373 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Xirp1O70373 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Xirp1O70373 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Xirp1O70373 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Xirp1O70373 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Xirp1O70373 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Xirp1O70373 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Xirp1O70373 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Xirp1O70373 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Xirp1O70373 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Xirp1O70373 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Xirp1O70373 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Xirp1O70373 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Xirp1O70373 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Xirp1O70373 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Xirp1O70373 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Xirp1O70373 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Xirp1O70373 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Xirp1O70373 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Xirp1O70373 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Xirp1O70373 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Xirp1O70373 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Xirp1O70373 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Xirp1O70373 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Xirp1O70373 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Xirp1O70373 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Xirp1O70373 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Xirp1O70373 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Xirp1O70373 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Xirp1O70373 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Xirp1O70373 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Xirp1O70373 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Xirp1O70373 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Xirp1O70373 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Xirp1O70373 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Xirp1O70373 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Xirp1O70373 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Xirp1O70373 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Xirp1O70373 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Xirp1O70373 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms