Protein–RNA interactions for Protein: O70370

Ctss, Cathepsin S, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtssO70370 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CtssO70370 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CtssO70370 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CtssO70370 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CtssO70370 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CtssO70370 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CtssO70370 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CtssO70370 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CtssO70370 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CtssO70370 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CtssO70370 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CtssO70370 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CtssO70370 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CtssO70370 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CtssO70370 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CtssO70370 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CtssO70370 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CtssO70370 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CtssO70370 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CtssO70370 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CtssO70370 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CtssO70370 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CtssO70370 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CtssO70370 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CtssO70370 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CtssO70370 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CtssO70370 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CtssO70370 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CtssO70370 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CtssO70370 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CtssO70370 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CtssO70370 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CtssO70370 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CtssO70370 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CtssO70370 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CtssO70370 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CtssO70370 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CtssO70370 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CtssO70370 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CtssO70370 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CtssO70370 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CtssO70370 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CtssO70370 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CtssO70370 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CtssO70370 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CtssO70370 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CtssO70370 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CtssO70370 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CtssO70370 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CtssO70370 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CtssO70370 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CtssO70370 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CtssO70370 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CtssO70370 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CtssO70370 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CtssO70370 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CtssO70370 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CtssO70370 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CtssO70370 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CtssO70370 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CtssO70370 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CtssO70370 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CtssO70370 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CtssO70370 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CtssO70370 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CtssO70370 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CtssO70370 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CtssO70370 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CtssO70370 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CtssO70370 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CtssO70370 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CtssO70370 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CtssO70370 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CtssO70370 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CtssO70370 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CtssO70370 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CtssO70370 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CtssO70370 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CtssO70370 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CtssO70370 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CtssO70370 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CtssO70370 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CtssO70370 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CtssO70370 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CtssO70370 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CtssO70370 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CtssO70370 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CtssO70370 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CtssO70370 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CtssO70370 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CtssO70370 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CtssO70370 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CtssO70370 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CtssO70370 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CtssO70370 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CtssO70370 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CtssO70370 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CtssO70370 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CtssO70370 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CtssO70370 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms