Protein–RNA interactions for Protein: O70309

Itgb5, Integrin beta-5, mousemouse

Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb5O70309 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Itgb5O70309 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Itgb5O70309 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Itgb5O70309 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Itgb5O70309 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Itgb5O70309 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Itgb5O70309 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Itgb5O70309 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Itgb5O70309 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Itgb5O70309 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Itgb5O70309 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Itgb5O70309 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Itgb5O70309 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Itgb5O70309 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Itgb5O70309 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Itgb5O70309 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Itgb5O70309 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Itgb5O70309 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Itgb5O70309 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Itgb5O70309 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Itgb5O70309 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Itgb5O70309 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Itgb5O70309 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Itgb5O70309 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Itgb5O70309 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Itgb5O70309 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Itgb5O70309 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Itgb5O70309 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Itgb5O70309 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Itgb5O70309 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Itgb5O70309 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Itgb5O70309 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Itgb5O70309 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Itgb5O70309 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Itgb5O70309 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Itgb5O70309 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Itgb5O70309 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Itgb5O70309 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Itgb5O70309 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Itgb5O70309 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Itgb5O70309 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Itgb5O70309 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Itgb5O70309 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Itgb5O70309 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Itgb5O70309 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Itgb5O70309 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Itgb5O70309 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Itgb5O70309 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Itgb5O70309 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Itgb5O70309 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Itgb5O70309 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Itgb5O70309 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Itgb5O70309 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Itgb5O70309 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Itgb5O70309 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Itgb5O70309 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Itgb5O70309 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Itgb5O70309 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Itgb5O70309 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Itgb5O70309 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Itgb5O70309 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Itgb5O70309 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Itgb5O70309 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Itgb5O70309 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Itgb5O70309 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Itgb5O70309 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Itgb5O70309 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Itgb5O70309 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Itgb5O70309 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Itgb5O70309 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Itgb5O70309 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Itgb5O70309 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Itgb5O70309 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Itgb5O70309 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Itgb5O70309 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Itgb5O70309 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Itgb5O70309 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Itgb5O70309 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Itgb5O70309 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Itgb5O70309 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Itgb5O70309 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Itgb5O70309 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Itgb5O70309 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Itgb5O70309 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Itgb5O70309 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Itgb5O70309 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Itgb5O70309 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Itgb5O70309 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Itgb5O70309 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Itgb5O70309 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Itgb5O70309 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Itgb5O70309 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Itgb5O70309 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Itgb5O70309 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Itgb5O70309 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Itgb5O70309 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Itgb5O70309 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Itgb5O70309 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Itgb5O70309 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Itgb5O70309 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms