Protein–RNA interactions for Protein: O70174

Chrna4, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna4O70174 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Chrna4O70174 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Chrna4O70174 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Chrna4O70174 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Chrna4O70174 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Chrna4O70174 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Chrna4O70174 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Chrna4O70174 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Chrna4O70174 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Chrna4O70174 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Chrna4O70174 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Chrna4O70174 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Chrna4O70174 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Chrna4O70174 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Chrna4O70174 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Chrna4O70174 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Chrna4O70174 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Chrna4O70174 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Chrna4O70174 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Chrna4O70174 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Chrna4O70174 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Chrna4O70174 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Chrna4O70174 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Chrna4O70174 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Chrna4O70174 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Chrna4O70174 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Chrna4O70174 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Chrna4O70174 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Chrna4O70174 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Chrna4O70174 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Chrna4O70174 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Chrna4O70174 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Chrna4O70174 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Chrna4O70174 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Chrna4O70174 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Chrna4O70174 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Chrna4O70174 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Chrna4O70174 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Chrna4O70174 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Chrna4O70174 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Chrna4O70174 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Chrna4O70174 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Chrna4O70174 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Chrna4O70174 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Chrna4O70174 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Chrna4O70174 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Chrna4O70174 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Chrna4O70174 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Chrna4O70174 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Chrna4O70174 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Chrna4O70174 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Chrna4O70174 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Chrna4O70174 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Chrna4O70174 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Chrna4O70174 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Chrna4O70174 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Chrna4O70174 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Chrna4O70174 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Chrna4O70174 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Chrna4O70174 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Chrna4O70174 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Chrna4O70174 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Chrna4O70174 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Chrna4O70174 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Chrna4O70174 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Chrna4O70174 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Chrna4O70174 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Chrna4O70174 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Chrna4O70174 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Chrna4O70174 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Chrna4O70174 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Chrna4O70174 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Chrna4O70174 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Chrna4O70174 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Chrna4O70174 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Chrna4O70174 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Chrna4O70174 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Chrna4O70174 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Chrna4O70174 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Chrna4O70174 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Chrna4O70174 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Chrna4O70174 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Chrna4O70174 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Chrna4O70174 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Chrna4O70174 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Chrna4O70174 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Chrna4O70174 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Chrna4O70174 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Chrna4O70174 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Chrna4O70174 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Chrna4O70174 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Chrna4O70174 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Chrna4O70174 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Chrna4O70174 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Chrna4O70174 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Chrna4O70174 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Chrna4O70174 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Chrna4O70174 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Chrna4O70174 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Chrna4O70174 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.6 ms