Protein–RNA interactions for Protein: O70137

Alx3, Homeobox protein aristaless-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alx3O70137 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Alx3O70137 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Alx3O70137 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Alx3O70137 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Alx3O70137 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Alx3O70137 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Alx3O70137 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Alx3O70137 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Alx3O70137 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Alx3O70137 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Alx3O70137 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Alx3O70137 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Alx3O70137 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Alx3O70137 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Alx3O70137 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Alx3O70137 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Alx3O70137 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Alx3O70137 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Alx3O70137 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Alx3O70137 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Alx3O70137 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Alx3O70137 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Alx3O70137 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Alx3O70137 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Alx3O70137 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Alx3O70137 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Alx3O70137 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Alx3O70137 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Alx3O70137 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Alx3O70137 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Alx3O70137 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Alx3O70137 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Alx3O70137 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Alx3O70137 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Alx3O70137 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Alx3O70137 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Alx3O70137 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Alx3O70137 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Alx3O70137 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Alx3O70137 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Alx3O70137 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Alx3O70137 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Alx3O70137 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Alx3O70137 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Alx3O70137 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Alx3O70137 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Alx3O70137 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Alx3O70137 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Alx3O70137 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Alx3O70137 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Alx3O70137 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Alx3O70137 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Alx3O70137 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Alx3O70137 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Alx3O70137 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Alx3O70137 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Alx3O70137 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Alx3O70137 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Alx3O70137 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Alx3O70137 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Alx3O70137 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Alx3O70137 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Alx3O70137 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Alx3O70137 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Alx3O70137 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Alx3O70137 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Alx3O70137 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Alx3O70137 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Alx3O70137 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Alx3O70137 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Alx3O70137 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Alx3O70137 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Alx3O70137 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Alx3O70137 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Alx3O70137 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Alx3O70137 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Alx3O70137 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Alx3O70137 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Alx3O70137 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Alx3O70137 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Alx3O70137 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Alx3O70137 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Alx3O70137 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Alx3O70137 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Alx3O70137 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Alx3O70137 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Alx3O70137 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Alx3O70137 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Alx3O70137 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Alx3O70137 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Alx3O70137 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Alx3O70137 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Alx3O70137 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Alx3O70137 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Alx3O70137 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Alx3O70137 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Alx3O70137 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Alx3O70137 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Alx3O70137 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Alx3O70137 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms