Protein–RNA interactions for Protein: O55234

Psmb5, Proteasome subunit beta type-5, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb5O55234 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Psmb5O55234 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Psmb5O55234 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Psmb5O55234 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Psmb5O55234 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Psmb5O55234 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Psmb5O55234 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Psmb5O55234 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Psmb5O55234 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Psmb5O55234 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Psmb5O55234 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Psmb5O55234 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Psmb5O55234 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Psmb5O55234 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Psmb5O55234 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Psmb5O55234 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Psmb5O55234 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Psmb5O55234 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Psmb5O55234 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Psmb5O55234 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Psmb5O55234 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Psmb5O55234 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Psmb5O55234 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Psmb5O55234 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Psmb5O55234 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Psmb5O55234 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Psmb5O55234 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Psmb5O55234 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Psmb5O55234 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Psmb5O55234 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Psmb5O55234 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Psmb5O55234 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Psmb5O55234 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Psmb5O55234 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Psmb5O55234 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Psmb5O55234 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Psmb5O55234 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Psmb5O55234 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Psmb5O55234 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Psmb5O55234 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Psmb5O55234 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Psmb5O55234 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Psmb5O55234 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Psmb5O55234 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Psmb5O55234 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Psmb5O55234 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Psmb5O55234 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Psmb5O55234 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Psmb5O55234 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Psmb5O55234 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Psmb5O55234 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Psmb5O55234 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Psmb5O55234 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Psmb5O55234 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Psmb5O55234 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Psmb5O55234 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Psmb5O55234 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Psmb5O55234 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Psmb5O55234 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Psmb5O55234 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Psmb5O55234 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Psmb5O55234 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Psmb5O55234 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Psmb5O55234 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Psmb5O55234 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Psmb5O55234 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Psmb5O55234 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Psmb5O55234 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Psmb5O55234 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Psmb5O55234 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Psmb5O55234 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Psmb5O55234 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Psmb5O55234 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Psmb5O55234 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Psmb5O55234 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Psmb5O55234 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Psmb5O55234 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Psmb5O55234 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Psmb5O55234 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Psmb5O55234 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Psmb5O55234 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Psmb5O55234 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Psmb5O55234 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Psmb5O55234 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Psmb5O55234 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Psmb5O55234 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Psmb5O55234 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Psmb5O55234 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Psmb5O55234 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Psmb5O55234 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Psmb5O55234 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Psmb5O55234 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Psmb5O55234 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Psmb5O55234 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Psmb5O55234 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Psmb5O55234 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Psmb5O55234 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Psmb5O55234 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Psmb5O55234 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Psmb5O55234 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms