Protein–RNA interactions for Protein: O55226

Chad, Chondroadherin, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChadO55226 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ChadO55226 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ChadO55226 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ChadO55226 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ChadO55226 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ChadO55226 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
ChadO55226 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ChadO55226 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ChadO55226 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ChadO55226 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ChadO55226 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ChadO55226 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ChadO55226 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ChadO55226 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
ChadO55226 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ChadO55226 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ChadO55226 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ChadO55226 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ChadO55226 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ChadO55226 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ChadO55226 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ChadO55226 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ChadO55226 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ChadO55226 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ChadO55226 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ChadO55226 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ChadO55226 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ChadO55226 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ChadO55226 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ChadO55226 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ChadO55226 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ChadO55226 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ChadO55226 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ChadO55226 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ChadO55226 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ChadO55226 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ChadO55226 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ChadO55226 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ChadO55226 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ChadO55226 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ChadO55226 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ChadO55226 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ChadO55226 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ChadO55226 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ChadO55226 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ChadO55226 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ChadO55226 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ChadO55226 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ChadO55226 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ChadO55226 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ChadO55226 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ChadO55226 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ChadO55226 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ChadO55226 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ChadO55226 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ChadO55226 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ChadO55226 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ChadO55226 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ChadO55226 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ChadO55226 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ChadO55226 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ChadO55226 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ChadO55226 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ChadO55226 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ChadO55226 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ChadO55226 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ChadO55226 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ChadO55226 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ChadO55226 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
ChadO55226 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
ChadO55226 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ChadO55226 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ChadO55226 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ChadO55226 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ChadO55226 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ChadO55226 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ChadO55226 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ChadO55226 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ChadO55226 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ChadO55226 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ChadO55226 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ChadO55226 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ChadO55226 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ChadO55226 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ChadO55226 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ChadO55226 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ChadO55226 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ChadO55226 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ChadO55226 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ChadO55226 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ChadO55226 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ChadO55226 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ChadO55226 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ChadO55226 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ChadO55226 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
ChadO55226 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ChadO55226 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ChadO55226 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ChadO55226 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ChadO55226 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms