Protein–RNA interactions for Protein: O55100

Syngr1, Synaptogyrin-1, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngr1O55100 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Syngr1O55100 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Syngr1O55100 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Syngr1O55100 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Syngr1O55100 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Syngr1O55100 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Syngr1O55100 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Syngr1O55100 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Syngr1O55100 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Syngr1O55100 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Syngr1O55100 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Syngr1O55100 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Syngr1O55100 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Syngr1O55100 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Syngr1O55100 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Syngr1O55100 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Syngr1O55100 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Syngr1O55100 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Syngr1O55100 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Syngr1O55100 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Syngr1O55100 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Syngr1O55100 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Syngr1O55100 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Syngr1O55100 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Syngr1O55100 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Syngr1O55100 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Syngr1O55100 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Syngr1O55100 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Syngr1O55100 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Syngr1O55100 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Syngr1O55100 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Syngr1O55100 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Syngr1O55100 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Syngr1O55100 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Syngr1O55100 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Syngr1O55100 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Syngr1O55100 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Syngr1O55100 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Syngr1O55100 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Syngr1O55100 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Syngr1O55100 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Syngr1O55100 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Syngr1O55100 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Syngr1O55100 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Syngr1O55100 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Syngr1O55100 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Syngr1O55100 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Syngr1O55100 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Syngr1O55100 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Syngr1O55100 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Syngr1O55100 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Syngr1O55100 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Syngr1O55100 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Syngr1O55100 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Syngr1O55100 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Syngr1O55100 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Syngr1O55100 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Syngr1O55100 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Syngr1O55100 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Syngr1O55100 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Syngr1O55100 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Syngr1O55100 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Syngr1O55100 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Syngr1O55100 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Syngr1O55100 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Syngr1O55100 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Syngr1O55100 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Syngr1O55100 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Syngr1O55100 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Syngr1O55100 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Syngr1O55100 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Syngr1O55100 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Syngr1O55100 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Syngr1O55100 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Syngr1O55100 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Syngr1O55100 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Syngr1O55100 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Syngr1O55100 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Syngr1O55100 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Syngr1O55100 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Syngr1O55100 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Syngr1O55100 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Syngr1O55100 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Syngr1O55100 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Syngr1O55100 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Syngr1O55100 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Syngr1O55100 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Syngr1O55100 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Syngr1O55100 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Syngr1O55100 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Syngr1O55100 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Syngr1O55100 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Syngr1O55100 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Syngr1O55100 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Syngr1O55100 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Syngr1O55100 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Syngr1O55100 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Syngr1O55100 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Syngr1O55100 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Syngr1O55100 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms