Protein–RNA interactions for Protein: O54965

Rnf13, E3 ubiquitin-protein ligase RNF13, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf13O54965 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rnf13O54965 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rnf13O54965 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rnf13O54965 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rnf13O54965 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rnf13O54965 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rnf13O54965 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rnf13O54965 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rnf13O54965 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rnf13O54965 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rnf13O54965 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rnf13O54965 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rnf13O54965 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rnf13O54965 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnf13O54965 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnf13O54965 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnf13O54965 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnf13O54965 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnf13O54965 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnf13O54965 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnf13O54965 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnf13O54965 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnf13O54965 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnf13O54965 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnf13O54965 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnf13O54965 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnf13O54965 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnf13O54965 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnf13O54965 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rnf13O54965 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rnf13O54965 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rnf13O54965 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rnf13O54965 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rnf13O54965 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rnf13O54965 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rnf13O54965 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rnf13O54965 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rnf13O54965 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rnf13O54965 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rnf13O54965 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rnf13O54965 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rnf13O54965 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rnf13O54965 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnf13O54965 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnf13O54965 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnf13O54965 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnf13O54965 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnf13O54965 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnf13O54965 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnf13O54965 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnf13O54965 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rnf13O54965 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rnf13O54965 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rnf13O54965 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rnf13O54965 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rnf13O54965 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rnf13O54965 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rnf13O54965 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rnf13O54965 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rnf13O54965 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rnf13O54965 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rnf13O54965 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rnf13O54965 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rnf13O54965 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnf13O54965 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnf13O54965 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnf13O54965 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnf13O54965 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnf13O54965 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnf13O54965 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnf13O54965 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnf13O54965 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnf13O54965 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnf13O54965 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnf13O54965 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnf13O54965 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnf13O54965 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnf13O54965 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnf13O54965 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnf13O54965 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnf13O54965 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnf13O54965 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnf13O54965 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnf13O54965 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnf13O54965 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnf13O54965 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnf13O54965 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnf13O54965 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnf13O54965 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnf13O54965 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnf13O54965 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnf13O54965 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnf13O54965 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnf13O54965 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnf13O54965 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnf13O54965 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnf13O54965 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rnf13O54965 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rnf13O54965 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rnf13O54965 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms