Protein–RNA interactions for Protein: O54956

Pole2, DNA polymerase epsilon subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pole2O54956 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pole2O54956 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pole2O54956 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Pole2O54956 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pole2O54956 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pole2O54956 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pole2O54956 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pole2O54956 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pole2O54956 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pole2O54956 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pole2O54956 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pole2O54956 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pole2O54956 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pole2O54956 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pole2O54956 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pole2O54956 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pole2O54956 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pole2O54956 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pole2O54956 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pole2O54956 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pole2O54956 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pole2O54956 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Pole2O54956 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pole2O54956 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pole2O54956 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pole2O54956 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pole2O54956 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pole2O54956 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pole2O54956 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pole2O54956 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pole2O54956 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pole2O54956 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pole2O54956 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pole2O54956 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pole2O54956 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pole2O54956 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pole2O54956 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pole2O54956 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pole2O54956 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pole2O54956 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pole2O54956 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pole2O54956 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pole2O54956 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pole2O54956 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pole2O54956 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pole2O54956 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pole2O54956 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pole2O54956 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pole2O54956 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pole2O54956 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pole2O54956 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pole2O54956 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pole2O54956 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pole2O54956 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pole2O54956 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pole2O54956 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pole2O54956 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pole2O54956 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pole2O54956 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pole2O54956 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pole2O54956 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pole2O54956 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pole2O54956 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pole2O54956 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pole2O54956 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pole2O54956 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pole2O54956 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pole2O54956 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pole2O54956 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pole2O54956 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pole2O54956 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pole2O54956 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pole2O54956 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pole2O54956 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pole2O54956 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pole2O54956 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pole2O54956 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pole2O54956 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pole2O54956 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pole2O54956 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pole2O54956 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pole2O54956 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pole2O54956 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pole2O54956 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pole2O54956 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pole2O54956 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pole2O54956 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pole2O54956 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pole2O54956 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pole2O54956 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pole2O54956 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pole2O54956 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Pole2O54956 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pole2O54956 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pole2O54956 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pole2O54956 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pole2O54956 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pole2O54956 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pole2O54956 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pole2O54956 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms