Protein–RNA interactions for Protein: O54949

Nlk, Serine/threonine-protein kinase NLK, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NlkO54949 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NlkO54949 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NlkO54949 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NlkO54949 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NlkO54949 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NlkO54949 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NlkO54949 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NlkO54949 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NlkO54949 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NlkO54949 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NlkO54949 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NlkO54949 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NlkO54949 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NlkO54949 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NlkO54949 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NlkO54949 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NlkO54949 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NlkO54949 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NlkO54949 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NlkO54949 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NlkO54949 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NlkO54949 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
NlkO54949 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NlkO54949 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NlkO54949 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NlkO54949 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NlkO54949 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NlkO54949 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NlkO54949 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NlkO54949 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NlkO54949 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NlkO54949 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NlkO54949 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NlkO54949 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NlkO54949 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
NlkO54949 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NlkO54949 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NlkO54949 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NlkO54949 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NlkO54949 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NlkO54949 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NlkO54949 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NlkO54949 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NlkO54949 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NlkO54949 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NlkO54949 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NlkO54949 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NlkO54949 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NlkO54949 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NlkO54949 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NlkO54949 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
NlkO54949 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NlkO54949 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NlkO54949 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NlkO54949 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NlkO54949 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NlkO54949 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NlkO54949 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NlkO54949 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NlkO54949 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NlkO54949 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NlkO54949 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NlkO54949 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NlkO54949 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NlkO54949 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NlkO54949 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NlkO54949 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NlkO54949 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NlkO54949 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NlkO54949 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NlkO54949 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NlkO54949 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
NlkO54949 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NlkO54949 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NlkO54949 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NlkO54949 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NlkO54949 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NlkO54949 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NlkO54949 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NlkO54949 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NlkO54949 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NlkO54949 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NlkO54949 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NlkO54949 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NlkO54949 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NlkO54949 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NlkO54949 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NlkO54949 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NlkO54949 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NlkO54949 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NlkO54949 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NlkO54949 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NlkO54949 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NlkO54949 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NlkO54949 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NlkO54949 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NlkO54949 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
NlkO54949 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NlkO54949 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NlkO54949 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms