Protein–RNA interactions for Protein: O54909

Rdh16, Cis-retinol androgen dehydrogenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh16O54909 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rdh16O54909 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rdh16O54909 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rdh16O54909 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rdh16O54909 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rdh16O54909 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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Rdh16O54909 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
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Rdh16O54909 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rdh16O54909 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rdh16O54909 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rdh16O54909 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rdh16O54909 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
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Rdh16O54909 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
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Rdh16O54909 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rdh16O54909 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
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Rdh16O54909 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rdh16O54909 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rdh16O54909 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rdh16O54909 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rdh16O54909 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rdh16O54909 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rdh16O54909 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
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Rdh16O54909 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
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Rdh16O54909 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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Rdh16O54909 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Rdh16O54909 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Rdh16O54909 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rdh16O54909 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rdh16O54909 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rdh16O54909 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rdh16O54909 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rdh16O54909 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rdh16O54909 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rdh16O54909 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Rdh16O54909 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rdh16O54909 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rdh16O54909 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rdh16O54909 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Rdh16O54909 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
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