Protein–RNA interactions for Protein: O54887

Tsks, Testis-specific serine kinase substrate, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TsksO54887 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TsksO54887 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
TsksO54887 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TsksO54887 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TsksO54887 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TsksO54887 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TsksO54887 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TsksO54887 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TsksO54887 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
TsksO54887 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TsksO54887 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
TsksO54887 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TsksO54887 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TsksO54887 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TsksO54887 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TsksO54887 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TsksO54887 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TsksO54887 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TsksO54887 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TsksO54887 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TsksO54887 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
TsksO54887 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TsksO54887 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TsksO54887 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TsksO54887 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TsksO54887 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TsksO54887 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TsksO54887 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TsksO54887 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TsksO54887 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TsksO54887 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TsksO54887 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TsksO54887 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TsksO54887 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TsksO54887 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TsksO54887 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TsksO54887 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TsksO54887 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TsksO54887 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TsksO54887 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TsksO54887 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TsksO54887 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TsksO54887 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TsksO54887 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TsksO54887 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TsksO54887 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TsksO54887 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TsksO54887 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TsksO54887 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TsksO54887 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TsksO54887 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TsksO54887 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TsksO54887 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TsksO54887 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TsksO54887 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TsksO54887 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TsksO54887 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TsksO54887 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TsksO54887 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TsksO54887 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TsksO54887 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TsksO54887 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TsksO54887 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TsksO54887 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TsksO54887 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TsksO54887 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TsksO54887 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TsksO54887 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TsksO54887 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TsksO54887 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TsksO54887 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TsksO54887 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TsksO54887 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TsksO54887 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TsksO54887 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TsksO54887 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TsksO54887 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TsksO54887 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TsksO54887 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TsksO54887 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TsksO54887 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TsksO54887 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TsksO54887 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TsksO54887 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TsksO54887 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TsksO54887 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TsksO54887 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TsksO54887 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
TsksO54887 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TsksO54887 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TsksO54887 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TsksO54887 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TsksO54887 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TsksO54887 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TsksO54887 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TsksO54887 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TsksO54887 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TsksO54887 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TsksO54887 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TsksO54887 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms