Protein–RNA interactions for Protein: O54827

Atp10a, Probable phospholipid-transporting ATPase VA, mousemouse

Predictions only

Length 1,508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp10aO54827 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Atp10aO54827 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Atp10aO54827 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Atp10aO54827 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC29.95■■■□□ 2.38
Atp10aO54827 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC29.95■■■□□ 2.38
Atp10aO54827 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Atp10aO54827 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Atp10aO54827 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
Atp10aO54827 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Atp10aO54827 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Atp10aO54827 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Atp10aO54827 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Atp10aO54827 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Atp10aO54827 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Atp10aO54827 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Atp10aO54827 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
Atp10aO54827 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Atp10aO54827 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Atp10aO54827 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Atp10aO54827 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Atp10aO54827 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Atp10aO54827 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Atp10aO54827 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Atp10aO54827 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Atp10aO54827 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
Atp10aO54827 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Atp10aO54827 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Atp10aO54827 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Atp10aO54827 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Atp10aO54827 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Atp10aO54827 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Atp10aO54827 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Atp10aO54827 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
Atp10aO54827 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
Atp10aO54827 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Atp10aO54827 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Atp10aO54827 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Atp10aO54827 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Atp10aO54827 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Atp10aO54827 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Atp10aO54827 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Atp10aO54827 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Atp10aO54827 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Atp10aO54827 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Atp10aO54827 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Atp10aO54827 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Atp10aO54827 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
Atp10aO54827 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Atp10aO54827 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Atp10aO54827 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Atp10aO54827 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Atp10aO54827 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Atp10aO54827 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Atp10aO54827 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Atp10aO54827 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Atp10aO54827 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
Atp10aO54827 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
Atp10aO54827 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Atp10aO54827 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Atp10aO54827 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
Atp10aO54827 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Atp10aO54827 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Atp10aO54827 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Atp10aO54827 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Atp10aO54827 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Atp10aO54827 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
Atp10aO54827 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Atp10aO54827 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Atp10aO54827 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Atp10aO54827 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Atp10aO54827 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Atp10aO54827 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Atp10aO54827 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Atp10aO54827 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Atp10aO54827 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Atp10aO54827 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Atp10aO54827 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Atp10aO54827 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Atp10aO54827 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Atp10aO54827 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
Atp10aO54827 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Atp10aO54827 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Atp10aO54827 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Atp10aO54827 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
Atp10aO54827 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Atp10aO54827 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Atp10aO54827 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Atp10aO54827 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Atp10aO54827 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Atp10aO54827 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Atp10aO54827 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Atp10aO54827 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Atp10aO54827 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
Atp10aO54827 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
Atp10aO54827 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Atp10aO54827 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Atp10aO54827 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Atp10aO54827 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Atp10aO54827 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Atp10aO54827 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms