Protein–RNA interactions for Protein: O35864

Cops5, COP9 signalosome complex subunit 5, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops5O35864 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cops5O35864 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cops5O35864 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cops5O35864 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cops5O35864 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cops5O35864 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cops5O35864 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cops5O35864 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cops5O35864 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cops5O35864 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Cops5O35864 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cops5O35864 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cops5O35864 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cops5O35864 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Cops5O35864 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Cops5O35864 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cops5O35864 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cops5O35864 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cops5O35864 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cops5O35864 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cops5O35864 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cops5O35864 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cops5O35864 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cops5O35864 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cops5O35864 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cops5O35864 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cops5O35864 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cops5O35864 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cops5O35864 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cops5O35864 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cops5O35864 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Cops5O35864 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cops5O35864 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Cops5O35864 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cops5O35864 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cops5O35864 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cops5O35864 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cops5O35864 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cops5O35864 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cops5O35864 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cops5O35864 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cops5O35864 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cops5O35864 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cops5O35864 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cops5O35864 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cops5O35864 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cops5O35864 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cops5O35864 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cops5O35864 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cops5O35864 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cops5O35864 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cops5O35864 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cops5O35864 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cops5O35864 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cops5O35864 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cops5O35864 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cops5O35864 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cops5O35864 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cops5O35864 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cops5O35864 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cops5O35864 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cops5O35864 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cops5O35864 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cops5O35864 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cops5O35864 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cops5O35864 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cops5O35864 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cops5O35864 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cops5O35864 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cops5O35864 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cops5O35864 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cops5O35864 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cops5O35864 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cops5O35864 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Cops5O35864 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Cops5O35864 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Cops5O35864 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cops5O35864 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cops5O35864 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cops5O35864 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cops5O35864 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cops5O35864 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cops5O35864 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Cops5O35864 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cops5O35864 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cops5O35864 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cops5O35864 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cops5O35864 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Cops5O35864 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cops5O35864 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cops5O35864 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Cops5O35864 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Cops5O35864 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cops5O35864 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cops5O35864 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cops5O35864 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cops5O35864 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cops5O35864 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cops5O35864 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cops5O35864 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms