Protein–RNA interactions for Protein: O35691

Pnn, Pinin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 725 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PnnO35691 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PnnO35691 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PnnO35691 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PnnO35691 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PnnO35691 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PnnO35691 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PnnO35691 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PnnO35691 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PnnO35691 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PnnO35691 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PnnO35691 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PnnO35691 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PnnO35691 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PnnO35691 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PnnO35691 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PnnO35691 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PnnO35691 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PnnO35691 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PnnO35691 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PnnO35691 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PnnO35691 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PnnO35691 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PnnO35691 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PnnO35691 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PnnO35691 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PnnO35691 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PnnO35691 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PnnO35691 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PnnO35691 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PnnO35691 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PnnO35691 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PnnO35691 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PnnO35691 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PnnO35691 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PnnO35691 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PnnO35691 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PnnO35691 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PnnO35691 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PnnO35691 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PnnO35691 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PnnO35691 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PnnO35691 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PnnO35691 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PnnO35691 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PnnO35691 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
PnnO35691 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
PnnO35691 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
PnnO35691 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PnnO35691 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PnnO35691 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PnnO35691 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PnnO35691 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PnnO35691 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PnnO35691 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PnnO35691 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PnnO35691 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PnnO35691 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PnnO35691 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PnnO35691 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PnnO35691 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PnnO35691 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PnnO35691 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PnnO35691 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PnnO35691 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PnnO35691 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PnnO35691 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PnnO35691 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PnnO35691 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PnnO35691 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PnnO35691 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PnnO35691 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PnnO35691 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PnnO35691 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PnnO35691 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PnnO35691 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PnnO35691 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PnnO35691 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PnnO35691 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PnnO35691 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PnnO35691 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PnnO35691 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PnnO35691 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PnnO35691 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PnnO35691 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PnnO35691 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PnnO35691 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PnnO35691 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PnnO35691 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PnnO35691 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PnnO35691 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PnnO35691 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PnnO35691 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PnnO35691 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PnnO35691 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PnnO35691 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PnnO35691 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PnnO35691 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PnnO35691 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PnnO35691 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PnnO35691 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms