Protein–RNA interactions for Protein: O35491

Clk2, Dual specificity protein kinase CLK2, mousemouse

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk2O35491 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Clk2O35491 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Clk2O35491 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Clk2O35491 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Clk2O35491 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Clk2O35491 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Clk2O35491 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Clk2O35491 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Clk2O35491 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Clk2O35491 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Clk2O35491 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Clk2O35491 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Clk2O35491 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Clk2O35491 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Clk2O35491 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Clk2O35491 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Clk2O35491 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Clk2O35491 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Clk2O35491 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Clk2O35491 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Clk2O35491 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Clk2O35491 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Clk2O35491 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Clk2O35491 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Clk2O35491 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Clk2O35491 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Clk2O35491 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Clk2O35491 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Clk2O35491 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Clk2O35491 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Clk2O35491 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Clk2O35491 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Clk2O35491 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Clk2O35491 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Clk2O35491 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Clk2O35491 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Clk2O35491 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Clk2O35491 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Clk2O35491 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Clk2O35491 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Clk2O35491 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Clk2O35491 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Clk2O35491 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Clk2O35491 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Clk2O35491 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Clk2O35491 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Clk2O35491 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Clk2O35491 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Clk2O35491 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Clk2O35491 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Clk2O35491 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Clk2O35491 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Clk2O35491 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Clk2O35491 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Clk2O35491 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Clk2O35491 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Clk2O35491 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Clk2O35491 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Clk2O35491 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Clk2O35491 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Clk2O35491 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Clk2O35491 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Clk2O35491 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Clk2O35491 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Clk2O35491 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Clk2O35491 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Clk2O35491 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Clk2O35491 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Clk2O35491 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Clk2O35491 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Clk2O35491 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Clk2O35491 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Clk2O35491 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Clk2O35491 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Clk2O35491 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Clk2O35491 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Clk2O35491 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Clk2O35491 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Clk2O35491 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Clk2O35491 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Clk2O35491 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Clk2O35491 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Clk2O35491 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Clk2O35491 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Clk2O35491 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Clk2O35491 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Clk2O35491 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Clk2O35491 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Clk2O35491 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Clk2O35491 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Clk2O35491 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Clk2O35491 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Clk2O35491 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Clk2O35491 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Clk2O35491 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Clk2O35491 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Clk2O35491 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Clk2O35491 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Clk2O35491 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Clk2O35491 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 141.5 ms