Protein–RNA interactions for Protein: O35452

Tnxb, Tenascin X, mousemouse

Predictions only

Length 4,006 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnxbO35452 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TnxbO35452 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TnxbO35452 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TnxbO35452 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TnxbO35452 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TnxbO35452 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TnxbO35452 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TnxbO35452 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TnxbO35452 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TnxbO35452 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TnxbO35452 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TnxbO35452 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TnxbO35452 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TnxbO35452 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TnxbO35452 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TnxbO35452 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TnxbO35452 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TnxbO35452 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TnxbO35452 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TnxbO35452 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TnxbO35452 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TnxbO35452 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TnxbO35452 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TnxbO35452 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TnxbO35452 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TnxbO35452 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TnxbO35452 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TnxbO35452 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TnxbO35452 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TnxbO35452 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TnxbO35452 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TnxbO35452 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TnxbO35452 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TnxbO35452 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TnxbO35452 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TnxbO35452 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TnxbO35452 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TnxbO35452 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TnxbO35452 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TnxbO35452 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TnxbO35452 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TnxbO35452 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TnxbO35452 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TnxbO35452 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TnxbO35452 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TnxbO35452 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TnxbO35452 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TnxbO35452 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TnxbO35452 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TnxbO35452 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TnxbO35452 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TnxbO35452 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TnxbO35452 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TnxbO35452 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TnxbO35452 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TnxbO35452 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TnxbO35452 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TnxbO35452 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TnxbO35452 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TnxbO35452 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TnxbO35452 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TnxbO35452 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TnxbO35452 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TnxbO35452 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TnxbO35452 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TnxbO35452 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TnxbO35452 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TnxbO35452 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TnxbO35452 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TnxbO35452 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TnxbO35452 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TnxbO35452 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TnxbO35452 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TnxbO35452 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TnxbO35452 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
TnxbO35452 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TnxbO35452 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TnxbO35452 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TnxbO35452 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TnxbO35452 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TnxbO35452 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TnxbO35452 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TnxbO35452 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
TnxbO35452 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TnxbO35452 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TnxbO35452 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TnxbO35452 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
TnxbO35452 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TnxbO35452 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TnxbO35452 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TnxbO35452 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TnxbO35452 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TnxbO35452 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TnxbO35452 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TnxbO35452 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC15.04■□□□□ -0
TnxbO35452 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TnxbO35452 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TnxbO35452 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TnxbO35452 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TnxbO35452 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms