Protein–RNA interactions for Protein: O35185

Bhlhe40, Class E basic helix-loop-helix protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe40O35185 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Bhlhe40O35185 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Bhlhe40O35185 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Bhlhe40O35185 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Bhlhe40O35185 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Bhlhe40O35185 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Bhlhe40O35185 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Bhlhe40O35185 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Bhlhe40O35185 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Bhlhe40O35185 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Bhlhe40O35185 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Bhlhe40O35185 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Bhlhe40O35185 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Bhlhe40O35185 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Bhlhe40O35185 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Bhlhe40O35185 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Bhlhe40O35185 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Bhlhe40O35185 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Bhlhe40O35185 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Bhlhe40O35185 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Bhlhe40O35185 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Bhlhe40O35185 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Bhlhe40O35185 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Bhlhe40O35185 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Bhlhe40O35185 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Bhlhe40O35185 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Bhlhe40O35185 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Bhlhe40O35185 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Bhlhe40O35185 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Bhlhe40O35185 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Bhlhe40O35185 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Bhlhe40O35185 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Bhlhe40O35185 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Bhlhe40O35185 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Bhlhe40O35185 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Bhlhe40O35185 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Bhlhe40O35185 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Bhlhe40O35185 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Bhlhe40O35185 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Bhlhe40O35185 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Bhlhe40O35185 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Bhlhe40O35185 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Bhlhe40O35185 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Bhlhe40O35185 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Bhlhe40O35185 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Bhlhe40O35185 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Bhlhe40O35185 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Bhlhe40O35185 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Bhlhe40O35185 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Bhlhe40O35185 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Bhlhe40O35185 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Bhlhe40O35185 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Bhlhe40O35185 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Bhlhe40O35185 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Bhlhe40O35185 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Bhlhe40O35185 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Bhlhe40O35185 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Bhlhe40O35185 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Bhlhe40O35185 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Bhlhe40O35185 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Bhlhe40O35185 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Bhlhe40O35185 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Bhlhe40O35185 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Bhlhe40O35185 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Bhlhe40O35185 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Bhlhe40O35185 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Bhlhe40O35185 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Bhlhe40O35185 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Bhlhe40O35185 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Bhlhe40O35185 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Bhlhe40O35185 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Bhlhe40O35185 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Bhlhe40O35185 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Bhlhe40O35185 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Bhlhe40O35185 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Bhlhe40O35185 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Bhlhe40O35185 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Bhlhe40O35185 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Bhlhe40O35185 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Bhlhe40O35185 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Bhlhe40O35185 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Bhlhe40O35185 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Bhlhe40O35185 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Bhlhe40O35185 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Bhlhe40O35185 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Bhlhe40O35185 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Bhlhe40O35185 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Bhlhe40O35185 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Bhlhe40O35185 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Bhlhe40O35185 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Bhlhe40O35185 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Bhlhe40O35185 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Bhlhe40O35185 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Bhlhe40O35185 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Bhlhe40O35185 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Bhlhe40O35185 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Bhlhe40O35185 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Bhlhe40O35185 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Bhlhe40O35185 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Bhlhe40O35185 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms