Protein–RNA interactions for Protein: O35085

Arx, Homeobox protein ARX, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ArxO35085 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ArxO35085 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ArxO35085 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ArxO35085 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ArxO35085 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ArxO35085 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ArxO35085 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ArxO35085 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ArxO35085 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ArxO35085 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ArxO35085 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ArxO35085 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ArxO35085 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ArxO35085 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ArxO35085 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ArxO35085 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ArxO35085 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ArxO35085 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ArxO35085 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ArxO35085 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ArxO35085 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ArxO35085 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ArxO35085 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ArxO35085 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ArxO35085 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
ArxO35085 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ArxO35085 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ArxO35085 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ArxO35085 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ArxO35085 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ArxO35085 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ArxO35085 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ArxO35085 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ArxO35085 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ArxO35085 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ArxO35085 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ArxO35085 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ArxO35085 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ArxO35085 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ArxO35085 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ArxO35085 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ArxO35085 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ArxO35085 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
ArxO35085 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ArxO35085 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ArxO35085 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ArxO35085 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ArxO35085 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ArxO35085 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ArxO35085 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ArxO35085 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ArxO35085 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ArxO35085 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ArxO35085 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
ArxO35085 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ArxO35085 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ArxO35085 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ArxO35085 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ArxO35085 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ArxO35085 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ArxO35085 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ArxO35085 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ArxO35085 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ArxO35085 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ArxO35085 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ArxO35085 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ArxO35085 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ArxO35085 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ArxO35085 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ArxO35085 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ArxO35085 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ArxO35085 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ArxO35085 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ArxO35085 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
ArxO35085 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ArxO35085 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ArxO35085 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ArxO35085 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ArxO35085 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ArxO35085 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ArxO35085 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ArxO35085 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ArxO35085 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ArxO35085 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ArxO35085 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ArxO35085 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ArxO35085 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ArxO35085 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ArxO35085 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ArxO35085 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ArxO35085 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
ArxO35085 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ArxO35085 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ArxO35085 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ArxO35085 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ArxO35085 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
ArxO35085 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ArxO35085 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ArxO35085 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ArxO35085 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms