Protein–RNA interactions for Protein: O08810

Eftud2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2O08810 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Eftud2O08810 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Eftud2O08810 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Eftud2O08810 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Eftud2O08810 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Eftud2O08810 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Eftud2O08810 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Eftud2O08810 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Eftud2O08810 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Eftud2O08810 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Eftud2O08810 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Eftud2O08810 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Eftud2O08810 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Eftud2O08810 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Eftud2O08810 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Eftud2O08810 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Eftud2O08810 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Eftud2O08810 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Eftud2O08810 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Eftud2O08810 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Eftud2O08810 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Eftud2O08810 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Eftud2O08810 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Eftud2O08810 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Eftud2O08810 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Eftud2O08810 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Eftud2O08810 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Eftud2O08810 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Eftud2O08810 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Eftud2O08810 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Eftud2O08810 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Eftud2O08810 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Eftud2O08810 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Eftud2O08810 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Eftud2O08810 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Eftud2O08810 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Eftud2O08810 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Eftud2O08810 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Eftud2O08810 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Eftud2O08810 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Eftud2O08810 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Eftud2O08810 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Eftud2O08810 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Eftud2O08810 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Eftud2O08810 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Eftud2O08810 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Eftud2O08810 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Eftud2O08810 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Eftud2O08810 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Eftud2O08810 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Eftud2O08810 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Eftud2O08810 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Eftud2O08810 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Eftud2O08810 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Eftud2O08810 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Eftud2O08810 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Eftud2O08810 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Eftud2O08810 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Eftud2O08810 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Eftud2O08810 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Eftud2O08810 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Eftud2O08810 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Eftud2O08810 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Eftud2O08810 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Eftud2O08810 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Eftud2O08810 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Eftud2O08810 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Eftud2O08810 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Eftud2O08810 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Eftud2O08810 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Eftud2O08810 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Eftud2O08810 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Eftud2O08810 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Eftud2O08810 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Eftud2O08810 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Eftud2O08810 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Eftud2O08810 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Eftud2O08810 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Eftud2O08810 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Eftud2O08810 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Eftud2O08810 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Eftud2O08810 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Eftud2O08810 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Eftud2O08810 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Eftud2O08810 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Eftud2O08810 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Eftud2O08810 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Eftud2O08810 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Eftud2O08810 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Eftud2O08810 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Eftud2O08810 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Eftud2O08810 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Eftud2O08810 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Eftud2O08810 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Eftud2O08810 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Eftud2O08810 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Eftud2O08810 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Eftud2O08810 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Eftud2O08810 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Eftud2O08810 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms