Protein–RNA interactions for Protein: O08686

Barx2, Homeobox protein BarH-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Barx2O08686 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Barx2O08686 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Barx2O08686 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Barx2O08686 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Barx2O08686 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Barx2O08686 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Barx2O08686 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Barx2O08686 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Barx2O08686 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Barx2O08686 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Barx2O08686 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Barx2O08686 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Barx2O08686 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Barx2O08686 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Barx2O08686 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Barx2O08686 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Barx2O08686 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Barx2O08686 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Barx2O08686 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Barx2O08686 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Barx2O08686 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Barx2O08686 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Barx2O08686 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Barx2O08686 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Barx2O08686 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Barx2O08686 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Barx2O08686 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Barx2O08686 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Barx2O08686 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Barx2O08686 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Barx2O08686 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Barx2O08686 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Barx2O08686 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Barx2O08686 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Barx2O08686 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Barx2O08686 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Barx2O08686 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Barx2O08686 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Barx2O08686 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Barx2O08686 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Barx2O08686 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Barx2O08686 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Barx2O08686 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Barx2O08686 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Barx2O08686 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Barx2O08686 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Barx2O08686 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Barx2O08686 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Barx2O08686 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Barx2O08686 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Barx2O08686 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Barx2O08686 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Barx2O08686 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Barx2O08686 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Barx2O08686 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Barx2O08686 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Barx2O08686 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Barx2O08686 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Barx2O08686 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Barx2O08686 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Barx2O08686 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Barx2O08686 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Barx2O08686 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Barx2O08686 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Barx2O08686 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Barx2O08686 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Barx2O08686 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Barx2O08686 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Barx2O08686 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Barx2O08686 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Barx2O08686 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Barx2O08686 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Barx2O08686 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Barx2O08686 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Barx2O08686 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Barx2O08686 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Barx2O08686 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Barx2O08686 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Barx2O08686 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Barx2O08686 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Barx2O08686 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Barx2O08686 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Barx2O08686 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Barx2O08686 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Barx2O08686 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Barx2O08686 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Barx2O08686 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Barx2O08686 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Barx2O08686 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Barx2O08686 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Barx2O08686 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Barx2O08686 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Barx2O08686 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Barx2O08686 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Barx2O08686 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Barx2O08686 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Barx2O08686 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Barx2O08686 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Barx2O08686 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Barx2O08686 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms