Protein–RNA interactions for Protein: O08601

Mttp, Microsomal triglyceride transfer protein large subunit, mousemouse

Predictions only

Length 894 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MttpO08601 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
MttpO08601 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
MttpO08601 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
MttpO08601 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
MttpO08601 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
MttpO08601 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
MttpO08601 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
MttpO08601 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
MttpO08601 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
MttpO08601 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
MttpO08601 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
MttpO08601 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
MttpO08601 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
MttpO08601 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
MttpO08601 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
MttpO08601 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
MttpO08601 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
MttpO08601 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
MttpO08601 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
MttpO08601 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
MttpO08601 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
MttpO08601 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
MttpO08601 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
MttpO08601 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
MttpO08601 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
MttpO08601 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
MttpO08601 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
MttpO08601 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
MttpO08601 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
MttpO08601 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
MttpO08601 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
MttpO08601 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
MttpO08601 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
MttpO08601 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
MttpO08601 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
MttpO08601 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
MttpO08601 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
MttpO08601 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
MttpO08601 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
MttpO08601 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
MttpO08601 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
MttpO08601 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
MttpO08601 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
MttpO08601 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
MttpO08601 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
MttpO08601 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
MttpO08601 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
MttpO08601 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
MttpO08601 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
MttpO08601 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
MttpO08601 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
MttpO08601 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
MttpO08601 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
MttpO08601 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
MttpO08601 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
MttpO08601 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
MttpO08601 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
MttpO08601 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
MttpO08601 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MttpO08601 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MttpO08601 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MttpO08601 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MttpO08601 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MttpO08601 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
MttpO08601 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
MttpO08601 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MttpO08601 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MttpO08601 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
MttpO08601 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MttpO08601 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MttpO08601 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MttpO08601 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MttpO08601 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MttpO08601 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
MttpO08601 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
MttpO08601 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MttpO08601 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MttpO08601 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
MttpO08601 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MttpO08601 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MttpO08601 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MttpO08601 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MttpO08601 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MttpO08601 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
MttpO08601 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MttpO08601 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MttpO08601 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MttpO08601 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MttpO08601 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MttpO08601 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MttpO08601 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MttpO08601 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MttpO08601 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MttpO08601 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MttpO08601 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MttpO08601 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
MttpO08601 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MttpO08601 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MttpO08601 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
MttpO08601 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
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