Protein–RNA interactions for Protein: M0QWN7

Usp35, Ubiquitin-specific peptidase 35, mousemouse

Predictions only

Length 1,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp35M0QWN7 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp35M0QWN7 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp35M0QWN7 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp35M0QWN7 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp35M0QWN7 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp35M0QWN7 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp35M0QWN7 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp35M0QWN7 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp35M0QWN7 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp35M0QWN7 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp35M0QWN7 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp35M0QWN7 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp35M0QWN7 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp35M0QWN7 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp35M0QWN7 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp35M0QWN7 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp35M0QWN7 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp35M0QWN7 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp35M0QWN7 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp35M0QWN7 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp35M0QWN7 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp35M0QWN7 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp35M0QWN7 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp35M0QWN7 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp35M0QWN7 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp35M0QWN7 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp35M0QWN7 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp35M0QWN7 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp35M0QWN7 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp35M0QWN7 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp35M0QWN7 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp35M0QWN7 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp35M0QWN7 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp35M0QWN7 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp35M0QWN7 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp35M0QWN7 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp35M0QWN7 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp35M0QWN7 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp35M0QWN7 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp35M0QWN7 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp35M0QWN7 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp35M0QWN7 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp35M0QWN7 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp35M0QWN7 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp35M0QWN7 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp35M0QWN7 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp35M0QWN7 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp35M0QWN7 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp35M0QWN7 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp35M0QWN7 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp35M0QWN7 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp35M0QWN7 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp35M0QWN7 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp35M0QWN7 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp35M0QWN7 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp35M0QWN7 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp35M0QWN7 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp35M0QWN7 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp35M0QWN7 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp35M0QWN7 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp35M0QWN7 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp35M0QWN7 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp35M0QWN7 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp35M0QWN7 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp35M0QWN7 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp35M0QWN7 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp35M0QWN7 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp35M0QWN7 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp35M0QWN7 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp35M0QWN7 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp35M0QWN7 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp35M0QWN7 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp35M0QWN7 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp35M0QWN7 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp35M0QWN7 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp35M0QWN7 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp35M0QWN7 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp35M0QWN7 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp35M0QWN7 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp35M0QWN7 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp35M0QWN7 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp35M0QWN7 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp35M0QWN7 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp35M0QWN7 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp35M0QWN7 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp35M0QWN7 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp35M0QWN7 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp35M0QWN7 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp35M0QWN7 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp35M0QWN7 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp35M0QWN7 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp35M0QWN7 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp35M0QWN7 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp35M0QWN7 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp35M0QWN7 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp35M0QWN7 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Usp35M0QWN7 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp35M0QWN7 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp35M0QWN7 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp35M0QWN7 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms