Protein–RNA interactions for Protein: L7N248

Gm6871, Predicted gene 6871, mousemouse

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Length 545 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6871L7N248 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm6871L7N248 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm6871L7N248 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm6871L7N248 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm6871L7N248 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm6871L7N248 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm6871L7N248 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm6871L7N248 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm6871L7N248 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm6871L7N248 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm6871L7N248 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm6871L7N248 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm6871L7N248 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm6871L7N248 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm6871L7N248 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm6871L7N248 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm6871L7N248 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm6871L7N248 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm6871L7N248 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm6871L7N248 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm6871L7N248 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm6871L7N248 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm6871L7N248 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm6871L7N248 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
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Gm6871L7N248 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm6871L7N248 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm6871L7N248 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm6871L7N248 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm6871L7N248 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm6871L7N248 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm6871L7N248 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Gm6871L7N248 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Gm6871L7N248 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm6871L7N248 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm6871L7N248 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Gm6871L7N248 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm6871L7N248 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm6871L7N248 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm6871L7N248 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
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Gm6871L7N248 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm6871L7N248 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm6871L7N248 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm6871L7N248 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm6871L7N248 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Gm6871L7N248 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm6871L7N248 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Gm6871L7N248 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm6871L7N248 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm6871L7N248 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm6871L7N248 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm6871L7N248 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm6871L7N248 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm6871L7N248 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm6871L7N248 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm6871L7N248 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm6871L7N248 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm6871L7N248 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm6871L7N248 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm6871L7N248 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm6871L7N248 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm6871L7N248 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm6871L7N248 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm6871L7N248 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm6871L7N248 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm6871L7N248 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm6871L7N248 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm6871L7N248 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm6871L7N248 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm6871L7N248 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm6871L7N248 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm6871L7N248 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm6871L7N248 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm6871L7N248 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm6871L7N248 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm6871L7N248 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm6871L7N248 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm6871L7N248 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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