Protein–RNA interactions for Protein: L7N244

Gm20878, Predicted gene, 20878, mousemouse

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Length 103 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20878L7N244 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm20878L7N244 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm20878L7N244 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm20878L7N244 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm20878L7N244 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm20878L7N244 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm20878L7N244 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm20878L7N244 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm20878L7N244 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm20878L7N244 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm20878L7N244 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm20878L7N244 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gm20878L7N244 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gm20878L7N244 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gm20878L7N244 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gm20878L7N244 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gm20878L7N244 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Gm20878L7N244 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gm20878L7N244 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gm20878L7N244 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gm20878L7N244 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gm20878L7N244 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Gm20878L7N244 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gm20878L7N244 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gm20878L7N244 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gm20878L7N244 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gm20878L7N244 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gm20878L7N244 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gm20878L7N244 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gm20878L7N244 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gm20878L7N244 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gm20878L7N244 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gm20878L7N244 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gm20878L7N244 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gm20878L7N244 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gm20878L7N244 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Gm20878L7N244 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gm20878L7N244 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gm20878L7N244 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gm20878L7N244 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gm20878L7N244 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gm20878L7N244 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gm20878L7N244 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Gm20878L7N244 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm20878L7N244 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm20878L7N244 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm20878L7N244 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm20878L7N244 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm20878L7N244 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm20878L7N244 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm20878L7N244 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm20878L7N244 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm20878L7N244 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm20878L7N244 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm20878L7N244 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm20878L7N244 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm20878L7N244 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm20878L7N244 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm20878L7N244 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm20878L7N244 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm20878L7N244 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm20878L7N244 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm20878L7N244 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm20878L7N244 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm20878L7N244 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm20878L7N244 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm20878L7N244 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm20878L7N244 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm20878L7N244 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm20878L7N244 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm20878L7N244 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm20878L7N244 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm20878L7N244 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm20878L7N244 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm20878L7N244 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm20878L7N244 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm20878L7N244 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm20878L7N244 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm20878L7N244 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm20878L7N244 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Gm20878L7N244 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Gm20878L7N244 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm20878L7N244 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm20878L7N244 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm20878L7N244 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm20878L7N244 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm20878L7N244 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm20878L7N244 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm20878L7N244 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm20878L7N244 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm20878L7N244 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm20878L7N244 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm20878L7N244 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm20878L7N244 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm20878L7N244 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm20878L7N244 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm20878L7N244 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm20878L7N244 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm20878L7N244 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm20878L7N244 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
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