Protein–RNA interactions for Protein: L7MU04

H2al1o, Histone H2A, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1oL7MU04 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
H2al1oL7MU04 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
H2al1oL7MU04 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
H2al1oL7MU04 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
H2al1oL7MU04 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
H2al1oL7MU04 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
H2al1oL7MU04 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
H2al1oL7MU04 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
H2al1oL7MU04 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
H2al1oL7MU04 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
H2al1oL7MU04 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
H2al1oL7MU04 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
H2al1oL7MU04 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
H2al1oL7MU04 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
H2al1oL7MU04 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
H2al1oL7MU04 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
H2al1oL7MU04 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
H2al1oL7MU04 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
H2al1oL7MU04 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
H2al1oL7MU04 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2al1oL7MU04 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2al1oL7MU04 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2al1oL7MU04 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2al1oL7MU04 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
H2al1oL7MU04 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2al1oL7MU04 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2al1oL7MU04 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2al1oL7MU04 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
H2al1oL7MU04 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2al1oL7MU04 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2al1oL7MU04 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2al1oL7MU04 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2al1oL7MU04 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2al1oL7MU04 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2al1oL7MU04 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2al1oL7MU04 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2al1oL7MU04 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2al1oL7MU04 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2al1oL7MU04 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2al1oL7MU04 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2al1oL7MU04 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
H2al1oL7MU04 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2al1oL7MU04 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2al1oL7MU04 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2al1oL7MU04 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2al1oL7MU04 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2al1oL7MU04 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2al1oL7MU04 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2al1oL7MU04 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2al1oL7MU04 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2al1oL7MU04 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2al1oL7MU04 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2al1oL7MU04 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2al1oL7MU04 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2al1oL7MU04 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2al1oL7MU04 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2al1oL7MU04 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
H2al1oL7MU04 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2al1oL7MU04 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2al1oL7MU04 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2al1oL7MU04 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
H2al1oL7MU04 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
H2al1oL7MU04 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
H2al1oL7MU04 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
H2al1oL7MU04 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
H2al1oL7MU04 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
H2al1oL7MU04 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
H2al1oL7MU04 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
H2al1oL7MU04 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
H2al1oL7MU04 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
H2al1oL7MU04 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
H2al1oL7MU04 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
H2al1oL7MU04 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
H2al1oL7MU04 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2al1oL7MU04 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2al1oL7MU04 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2al1oL7MU04 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2al1oL7MU04 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2al1oL7MU04 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2al1oL7MU04 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2al1oL7MU04 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2al1oL7MU04 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2al1oL7MU04 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2al1oL7MU04 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2al1oL7MU04 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
H2al1oL7MU04 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2al1oL7MU04 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2al1oL7MU04 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2al1oL7MU04 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2al1oL7MU04 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2al1oL7MU04 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2al1oL7MU04 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2al1oL7MU04 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2al1oL7MU04 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
H2al1oL7MU04 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
H2al1oL7MU04 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
H2al1oL7MU04 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
H2al1oL7MU04 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
H2al1oL7MU04 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
H2al1oL7MU04 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms