Protein–RNA interactions for Protein: J3QP49

Gm20795, Predicted gene, 20795, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20795J3QP49 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm20795J3QP49 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm20795J3QP49 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm20795J3QP49 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm20795J3QP49 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm20795J3QP49 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm20795J3QP49 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm20795J3QP49 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm20795J3QP49 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm20795J3QP49 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm20795J3QP49 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm20795J3QP49 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm20795J3QP49 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm20795J3QP49 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm20795J3QP49 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm20795J3QP49 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm20795J3QP49 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm20795J3QP49 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm20795J3QP49 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm20795J3QP49 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm20795J3QP49 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm20795J3QP49 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm20795J3QP49 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm20795J3QP49 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm20795J3QP49 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm20795J3QP49 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm20795J3QP49 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm20795J3QP49 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm20795J3QP49 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm20795J3QP49 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm20795J3QP49 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm20795J3QP49 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm20795J3QP49 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm20795J3QP49 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm20795J3QP49 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm20795J3QP49 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm20795J3QP49 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm20795J3QP49 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm20795J3QP49 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm20795J3QP49 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm20795J3QP49 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm20795J3QP49 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm20795J3QP49 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm20795J3QP49 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm20795J3QP49 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm20795J3QP49 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm20795J3QP49 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm20795J3QP49 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm20795J3QP49 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm20795J3QP49 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm20795J3QP49 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm20795J3QP49 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm20795J3QP49 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm20795J3QP49 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm20795J3QP49 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm20795J3QP49 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm20795J3QP49 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm20795J3QP49 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm20795J3QP49 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm20795J3QP49 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm20795J3QP49 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm20795J3QP49 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm20795J3QP49 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm20795J3QP49 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm20795J3QP49 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm20795J3QP49 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm20795J3QP49 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm20795J3QP49 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm20795J3QP49 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm20795J3QP49 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm20795J3QP49 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm20795J3QP49 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm20795J3QP49 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm20795J3QP49 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm20795J3QP49 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm20795J3QP49 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm20795J3QP49 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm20795J3QP49 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm20795J3QP49 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm20795J3QP49 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm20795J3QP49 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm20795J3QP49 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm20795J3QP49 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm20795J3QP49 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm20795J3QP49 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm20795J3QP49 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm20795J3QP49 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm20795J3QP49 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm20795J3QP49 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm20795J3QP49 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm20795J3QP49 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm20795J3QP49 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm20795J3QP49 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm20795J3QP49 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm20795J3QP49 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm20795J3QP49 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm20795J3QP49 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm20795J3QP49 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm20795J3QP49 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm20795J3QP49 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms