Protein–RNA interactions for Protein: G3X8R9

Tmigd3, Transmembrane domain-containing protein TMIGD3, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmigd3G3X8R9 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tmigd3G3X8R9 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tmigd3G3X8R9 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tmigd3G3X8R9 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tmigd3G3X8R9 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tmigd3G3X8R9 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tmigd3G3X8R9 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tmigd3G3X8R9 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tmigd3G3X8R9 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tmigd3G3X8R9 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tmigd3G3X8R9 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tmigd3G3X8R9 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tmigd3G3X8R9 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tmigd3G3X8R9 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tmigd3G3X8R9 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tmigd3G3X8R9 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tmigd3G3X8R9 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Tmigd3G3X8R9 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tmigd3G3X8R9 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tmigd3G3X8R9 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tmigd3G3X8R9 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tmigd3G3X8R9 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tmigd3G3X8R9 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tmigd3G3X8R9 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tmigd3G3X8R9 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tmigd3G3X8R9 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tmigd3G3X8R9 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tmigd3G3X8R9 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tmigd3G3X8R9 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tmigd3G3X8R9 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tmigd3G3X8R9 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tmigd3G3X8R9 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tmigd3G3X8R9 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tmigd3G3X8R9 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tmigd3G3X8R9 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tmigd3G3X8R9 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tmigd3G3X8R9 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tmigd3G3X8R9 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tmigd3G3X8R9 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tmigd3G3X8R9 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tmigd3G3X8R9 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tmigd3G3X8R9 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tmigd3G3X8R9 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tmigd3G3X8R9 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tmigd3G3X8R9 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tmigd3G3X8R9 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tmigd3G3X8R9 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tmigd3G3X8R9 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tmigd3G3X8R9 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tmigd3G3X8R9 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Tmigd3G3X8R9 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tmigd3G3X8R9 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tmigd3G3X8R9 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tmigd3G3X8R9 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tmigd3G3X8R9 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Tmigd3G3X8R9 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Tmigd3G3X8R9 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tmigd3G3X8R9 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tmigd3G3X8R9 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tmigd3G3X8R9 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tmigd3G3X8R9 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tmigd3G3X8R9 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tmigd3G3X8R9 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tmigd3G3X8R9 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tmigd3G3X8R9 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tmigd3G3X8R9 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tmigd3G3X8R9 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tmigd3G3X8R9 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tmigd3G3X8R9 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tmigd3G3X8R9 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tmigd3G3X8R9 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tmigd3G3X8R9 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tmigd3G3X8R9 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tmigd3G3X8R9 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tmigd3G3X8R9 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tmigd3G3X8R9 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Tmigd3G3X8R9 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tmigd3G3X8R9 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tmigd3G3X8R9 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tmigd3G3X8R9 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tmigd3G3X8R9 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tmigd3G3X8R9 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tmigd3G3X8R9 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tmigd3G3X8R9 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tmigd3G3X8R9 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tmigd3G3X8R9 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tmigd3G3X8R9 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tmigd3G3X8R9 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tmigd3G3X8R9 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tmigd3G3X8R9 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Tmigd3G3X8R9 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tmigd3G3X8R9 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tmigd3G3X8R9 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tmigd3G3X8R9 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tmigd3G3X8R9 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tmigd3G3X8R9 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tmigd3G3X8R9 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tmigd3G3X8R9 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tmigd3G3X8R9 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tmigd3G3X8R9 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms