Protein–RNA interactions for Protein: F8VPZ9

Bicra, BRD4-interacting chromatin-remodeling complex-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BicraF8VPZ9 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC37.5■■■■□ 3.59
BicraF8VPZ9 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.49■■■■□ 3.59
BicraF8VPZ9 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
BicraF8VPZ9 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
BicraF8VPZ9 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC37.49■■■■□ 3.59
BicraF8VPZ9 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.49■■■■□ 3.59
BicraF8VPZ9 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
BicraF8VPZ9 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
BicraF8VPZ9 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC37.48■■■■□ 3.59
BicraF8VPZ9 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC37.48■■■■□ 3.59
BicraF8VPZ9 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.47■■■■□ 3.59
BicraF8VPZ9 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
BicraF8VPZ9 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
BicraF8VPZ9 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC37.46■■■■□ 3.59
BicraF8VPZ9 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC37.46■■■■□ 3.59
BicraF8VPZ9 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC37.46■■■■□ 3.59
BicraF8VPZ9 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC37.46■■■■□ 3.59
BicraF8VPZ9 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.46■■■■□ 3.59
BicraF8VPZ9 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
BicraF8VPZ9 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC37.46■■■■□ 3.59
BicraF8VPZ9 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
BicraF8VPZ9 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
BicraF8VPZ9 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC37.45■■■■□ 3.59
BicraF8VPZ9 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
BicraF8VPZ9 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC37.45■■■■□ 3.59
BicraF8VPZ9 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
BicraF8VPZ9 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.44■■■■□ 3.58
BicraF8VPZ9 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
BicraF8VPZ9 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.44■■■■□ 3.58
BicraF8VPZ9 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC37.44■■■■□ 3.58
BicraF8VPZ9 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
BicraF8VPZ9 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
BicraF8VPZ9 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.43■■■■□ 3.58
BicraF8VPZ9 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
BicraF8VPZ9 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
BicraF8VPZ9 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.41■■■■□ 3.58
BicraF8VPZ9 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC37.41■■■■□ 3.58
BicraF8VPZ9 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC37.4■■■■□ 3.58
BicraF8VPZ9 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
BicraF8VPZ9 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
BicraF8VPZ9 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
BicraF8VPZ9 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC37.39■■■■□ 3.58
BicraF8VPZ9 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.58
BicraF8VPZ9 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC37.38■■■■□ 3.58
BicraF8VPZ9 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
BicraF8VPZ9 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
BicraF8VPZ9 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
BicraF8VPZ9 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
BicraF8VPZ9 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
BicraF8VPZ9 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC37.37■■■■□ 3.57
BicraF8VPZ9 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
BicraF8VPZ9 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
BicraF8VPZ9 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
BicraF8VPZ9 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
BicraF8VPZ9 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
BicraF8VPZ9 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
BicraF8VPZ9 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
BicraF8VPZ9 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
BicraF8VPZ9 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
BicraF8VPZ9 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
BicraF8VPZ9 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
BicraF8VPZ9 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC37.35■■■■□ 3.57
BicraF8VPZ9 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
BicraF8VPZ9 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC37.34■■■■□ 3.57
BicraF8VPZ9 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC37.34■■■■□ 3.57
BicraF8VPZ9 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
BicraF8VPZ9 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
BicraF8VPZ9 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
BicraF8VPZ9 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
BicraF8VPZ9 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
BicraF8VPZ9 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
BicraF8VPZ9 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
BicraF8VPZ9 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.33■■■■□ 3.57
BicraF8VPZ9 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
BicraF8VPZ9 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.57
BicraF8VPZ9 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
BicraF8VPZ9 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
BicraF8VPZ9 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
BicraF8VPZ9 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
BicraF8VPZ9 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC37.31■■■■□ 3.56
BicraF8VPZ9 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
BicraF8VPZ9 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
BicraF8VPZ9 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
BicraF8VPZ9 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
BicraF8VPZ9 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC37.29■■■■□ 3.56
BicraF8VPZ9 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC37.29■■■■□ 3.56
BicraF8VPZ9 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC37.29■■■■□ 3.56
BicraF8VPZ9 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC37.29■■■■□ 3.56
BicraF8VPZ9 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
BicraF8VPZ9 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC37.29■■■■□ 3.56
BicraF8VPZ9 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
BicraF8VPZ9 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.28■■■■□ 3.56
BicraF8VPZ9 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
BicraF8VPZ9 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.28■■■■□ 3.56
BicraF8VPZ9 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC37.28■■■■□ 3.56
BicraF8VPZ9 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
BicraF8VPZ9 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
BicraF8VPZ9 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
BicraF8VPZ9 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
BicraF8VPZ9 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms