Protein–RNA interactions for Protein: F8VPX6

Speer4a, Spermatogenesis-associated glutamate (E)-rich protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4aF8VPX6 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Speer4aF8VPX6 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Speer4aF8VPX6 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Speer4aF8VPX6 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Speer4aF8VPX6 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Speer4aF8VPX6 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Speer4aF8VPX6 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Speer4aF8VPX6 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Speer4aF8VPX6 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Speer4aF8VPX6 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Speer4aF8VPX6 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Speer4aF8VPX6 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Speer4aF8VPX6 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Speer4aF8VPX6 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Speer4aF8VPX6 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Speer4aF8VPX6 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Speer4aF8VPX6 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Speer4aF8VPX6 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Speer4aF8VPX6 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Speer4aF8VPX6 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Speer4aF8VPX6 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Speer4aF8VPX6 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Speer4aF8VPX6 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Speer4aF8VPX6 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Speer4aF8VPX6 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Speer4aF8VPX6 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Speer4aF8VPX6 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Speer4aF8VPX6 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Speer4aF8VPX6 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Speer4aF8VPX6 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Speer4aF8VPX6 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Speer4aF8VPX6 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Speer4aF8VPX6 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Speer4aF8VPX6 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Speer4aF8VPX6 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Speer4aF8VPX6 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Speer4aF8VPX6 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Speer4aF8VPX6 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Speer4aF8VPX6 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Speer4aF8VPX6 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Speer4aF8VPX6 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Speer4aF8VPX6 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Speer4aF8VPX6 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Speer4aF8VPX6 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Speer4aF8VPX6 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Speer4aF8VPX6 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Speer4aF8VPX6 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Speer4aF8VPX6 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Speer4aF8VPX6 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Speer4aF8VPX6 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Speer4aF8VPX6 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Speer4aF8VPX6 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Speer4aF8VPX6 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
Speer4aF8VPX6 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Speer4aF8VPX6 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Speer4aF8VPX6 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Speer4aF8VPX6 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Speer4aF8VPX6 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Speer4aF8VPX6 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Speer4aF8VPX6 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Speer4aF8VPX6 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Speer4aF8VPX6 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Speer4aF8VPX6 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Speer4aF8VPX6 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Speer4aF8VPX6 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Speer4aF8VPX6 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Speer4aF8VPX6 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Speer4aF8VPX6 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Speer4aF8VPX6 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Speer4aF8VPX6 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Speer4aF8VPX6 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Speer4aF8VPX6 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Speer4aF8VPX6 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Speer4aF8VPX6 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Speer4aF8VPX6 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Speer4aF8VPX6 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Speer4aF8VPX6 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Speer4aF8VPX6 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Speer4aF8VPX6 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Speer4aF8VPX6 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Speer4aF8VPX6 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Speer4aF8VPX6 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Speer4aF8VPX6 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Speer4aF8VPX6 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Speer4aF8VPX6 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Speer4aF8VPX6 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Speer4aF8VPX6 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Speer4aF8VPX6 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Speer4aF8VPX6 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Speer4aF8VPX6 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Speer4aF8VPX6 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Speer4aF8VPX6 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Speer4aF8VPX6 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Speer4aF8VPX6 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Speer4aF8VPX6 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Speer4aF8VPX6 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Speer4aF8VPX6 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Speer4aF8VPX6 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Speer4aF8VPX6 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Speer4aF8VPX6 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms