Protein–RNA interactions for Protein: F8VPQ2

Arid4a, AT-rich interactive domain 4A (RBP1-like), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arid4aF8VPQ2 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Arid4aF8VPQ2 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Arid4aF8VPQ2 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Arid4aF8VPQ2 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Arid4aF8VPQ2 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Arid4aF8VPQ2 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Arid4aF8VPQ2 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Arid4aF8VPQ2 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Arid4aF8VPQ2 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Arid4aF8VPQ2 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Arid4aF8VPQ2 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Arid4aF8VPQ2 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Arid4aF8VPQ2 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Arid4aF8VPQ2 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Arid4aF8VPQ2 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Arid4aF8VPQ2 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Arid4aF8VPQ2 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Arid4aF8VPQ2 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Arid4aF8VPQ2 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Arid4aF8VPQ2 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Arid4aF8VPQ2 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Arid4aF8VPQ2 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Arid4aF8VPQ2 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Arid4aF8VPQ2 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Arid4aF8VPQ2 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Arid4aF8VPQ2 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Arid4aF8VPQ2 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Arid4aF8VPQ2 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Arid4aF8VPQ2 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Arid4aF8VPQ2 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Arid4aF8VPQ2 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Arid4aF8VPQ2 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Arid4aF8VPQ2 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Arid4aF8VPQ2 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Arid4aF8VPQ2 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Arid4aF8VPQ2 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Arid4aF8VPQ2 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Arid4aF8VPQ2 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Arid4aF8VPQ2 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Arid4aF8VPQ2 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Arid4aF8VPQ2 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Arid4aF8VPQ2 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Arid4aF8VPQ2 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Arid4aF8VPQ2 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Arid4aF8VPQ2 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Arid4aF8VPQ2 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Arid4aF8VPQ2 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Arid4aF8VPQ2 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Arid4aF8VPQ2 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Arid4aF8VPQ2 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Arid4aF8VPQ2 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Arid4aF8VPQ2 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Arid4aF8VPQ2 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Arid4aF8VPQ2 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Arid4aF8VPQ2 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Arid4aF8VPQ2 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Arid4aF8VPQ2 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Arid4aF8VPQ2 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Arid4aF8VPQ2 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Arid4aF8VPQ2 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Arid4aF8VPQ2 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Arid4aF8VPQ2 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Arid4aF8VPQ2 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Arid4aF8VPQ2 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Arid4aF8VPQ2 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Arid4aF8VPQ2 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Arid4aF8VPQ2 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Arid4aF8VPQ2 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Arid4aF8VPQ2 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Arid4aF8VPQ2 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Arid4aF8VPQ2 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Arid4aF8VPQ2 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Arid4aF8VPQ2 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Arid4aF8VPQ2 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Arid4aF8VPQ2 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Arid4aF8VPQ2 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Arid4aF8VPQ2 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Arid4aF8VPQ2 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Arid4aF8VPQ2 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Arid4aF8VPQ2 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Arid4aF8VPQ2 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Arid4aF8VPQ2 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Arid4aF8VPQ2 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Arid4aF8VPQ2 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Arid4aF8VPQ2 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Arid4aF8VPQ2 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Arid4aF8VPQ2 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Arid4aF8VPQ2 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Arid4aF8VPQ2 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Arid4aF8VPQ2 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Arid4aF8VPQ2 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Arid4aF8VPQ2 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Arid4aF8VPQ2 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Arid4aF8VPQ2 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Arid4aF8VPQ2 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Arid4aF8VPQ2 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Arid4aF8VPQ2 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Arid4aF8VPQ2 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Arid4aF8VPQ2 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Arid4aF8VPQ2 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms