Protein–RNA interactions for Protein: F8VPP8

Zc3h7b, Zinc finger CCCH type-containing 7B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 982 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zc3h7bF8VPP8 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Zc3h7bF8VPP8 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Zc3h7bF8VPP8 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Zc3h7bF8VPP8 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Zc3h7bF8VPP8 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Zc3h7bF8VPP8 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Zc3h7bF8VPP8 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Zc3h7bF8VPP8 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Zc3h7bF8VPP8 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Zc3h7bF8VPP8 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Zc3h7bF8VPP8 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Zc3h7bF8VPP8 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Zc3h7bF8VPP8 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Zc3h7bF8VPP8 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Zc3h7bF8VPP8 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Zc3h7bF8VPP8 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Zc3h7bF8VPP8 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Zc3h7bF8VPP8 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Zc3h7bF8VPP8 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Zc3h7bF8VPP8 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Zc3h7bF8VPP8 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Zc3h7bF8VPP8 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Zc3h7bF8VPP8 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Zc3h7bF8VPP8 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Zc3h7bF8VPP8 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Zc3h7bF8VPP8 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Zc3h7bF8VPP8 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Zc3h7bF8VPP8 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Zc3h7bF8VPP8 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Zc3h7bF8VPP8 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Zc3h7bF8VPP8 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Zc3h7bF8VPP8 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Zc3h7bF8VPP8 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Zc3h7bF8VPP8 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Zc3h7bF8VPP8 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Zc3h7bF8VPP8 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Zc3h7bF8VPP8 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Zc3h7bF8VPP8 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Zc3h7bF8VPP8 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Zc3h7bF8VPP8 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Zc3h7bF8VPP8 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Zc3h7bF8VPP8 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Zc3h7bF8VPP8 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Zc3h7bF8VPP8 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Zc3h7bF8VPP8 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Zc3h7bF8VPP8 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Zc3h7bF8VPP8 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Zc3h7bF8VPP8 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Zc3h7bF8VPP8 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Zc3h7bF8VPP8 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Zc3h7bF8VPP8 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Zc3h7bF8VPP8 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Zc3h7bF8VPP8 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Zc3h7bF8VPP8 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Zc3h7bF8VPP8 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Zc3h7bF8VPP8 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Zc3h7bF8VPP8 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Zc3h7bF8VPP8 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Zc3h7bF8VPP8 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Zc3h7bF8VPP8 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Zc3h7bF8VPP8 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Zc3h7bF8VPP8 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Zc3h7bF8VPP8 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Zc3h7bF8VPP8 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Zc3h7bF8VPP8 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Zc3h7bF8VPP8 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Zc3h7bF8VPP8 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Zc3h7bF8VPP8 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Zc3h7bF8VPP8 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Zc3h7bF8VPP8 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Zc3h7bF8VPP8 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Zc3h7bF8VPP8 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zc3h7bF8VPP8 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zc3h7bF8VPP8 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zc3h7bF8VPP8 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zc3h7bF8VPP8 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zc3h7bF8VPP8 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zc3h7bF8VPP8 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Zc3h7bF8VPP8 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zc3h7bF8VPP8 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zc3h7bF8VPP8 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zc3h7bF8VPP8 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zc3h7bF8VPP8 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zc3h7bF8VPP8 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zc3h7bF8VPP8 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zc3h7bF8VPP8 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zc3h7bF8VPP8 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Zc3h7bF8VPP8 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Zc3h7bF8VPP8 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Zc3h7bF8VPP8 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Zc3h7bF8VPP8 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Zc3h7bF8VPP8 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Zc3h7bF8VPP8 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Zc3h7bF8VPP8 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Zc3h7bF8VPP8 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Zc3h7bF8VPP8 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Zc3h7bF8VPP8 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Zc3h7bF8VPP8 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zc3h7bF8VPP8 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zc3h7bF8VPP8 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms